
Пресмыка́ющиеся, или репти́лии (лат. Reptilia), — традиционно выделяемый класс преимущественно наземных позвоночных животных из клады амниот, включающий современных черепах, крокодилов, клювоголовых и чешуйчатых. Пресмыкающиеся являются парафилетической группой, так как дали начало птицам, но не включают их самих. В качестве монофилетической альтернативы класса выделяется клада завропсид, или рептилий в пересмотренном составе, в которую включают представителей традиционного класса пресмыкающихся и птиц.

Четвероно́гие, или тетрапо́ды (лат. Tetrapoda), — надкласс челюстноротых из группы костных позвоночных. Характерный признак четвероногих — наличие четырёх конечностей, обычно служащих для передвижения по суше. В некоторых группах конечности существенно видоизменились для полёта, плавания или редуцировались.

Черепа́хи (лат. Testudines) — отряд пресмыкающихся, один из четырёх современных отрядов этого класса. Характерной особенностью строения черепах является костно-роговой или костно-кожистый панцирь, состоящий из двух частей: карапакса и пластрона, и служащий основной защитой от врагов. Многие виды способны втягивать под панцирь голову, хвост и конечности. Размеры черепах от 12 см до 2 м. У них хорошо развиты зрение и обоняние, слух слабее. Челюсти лишены зубов и покрыты роговыми пластинками в виде клюва. Шейный и хвостовой отделы позвоночника подвижные, остальные неподвижно срастаются с карапаксом. Возникновение панциря эволюционно вызвало перемещение поясов конечностей под рёбра, что является исключительным случаем среди позвоночных.

Происхождение рептилий — один из важных вопросов в теории эволюции, процесс, в результате которого появились первые животные, относящиеся к классу Пресмыкающиеся.

Лопастепёрые рыбы, или мясистолопастные, или хоа́новые, или саркоптеригии (лат. Sarcopterygii), — класс костных рыб, к которому, согласно кладистическим данным, относятся четвероногие и некоторые родственные им группы. Известны с нижнего девона. Современные лопастепёрые, не являющиеся четвероногими, относятся к отрядам целакантообразных и рогозубообразных.

Амниоты — клада четвероногих, характеризующаяся наличием зародышевых оболочек. Первые амниоты возникли в каменноугольном периоде, около 320 млн лет назад. Группа входит в состав надкласса четвероногих (Tetrapoda) и подразделяется на две дочерние клады: завропсиды и синапсиды.

Архоза́вры (лат. Archosauria, от др.-греч. ἄρχω — правлю, начинаю и σαῦρος — ящерица) — клада диапсид, представленная в настоящее время крокодилами и птицами, а из вымерших организмов также: нептичьими динозаврами, птерозаврами и другими.

Завропси́ды, или ящерообра́зные (лат. Sauropsida), или репти́лии (лат. Reptilia), — клада амниот, объединяющая представителей традиционного класса пресмыкающихся и произошедших от них птиц. Все современные таксоны завропсид относятся к кроновой группе заврий (Sauria), давшей большое таксономическое и морфологическое разнообразие. В этой группе выделяется три основных эволюционных ветви : лепидозавры, архозавры и черепахи (Testudines).

Парарептилии (лат. Parareptilia) — подкласс или безранговая клада стволовых пресмыкающихся (завропсид). Таксон в систематику ввёл Э. Олсон в 1947 году.

Диа́псиды (лат. Diapsida) — подкласс пресмыкающихся или завропсид, сформировавшийся около 300 миллионов лет назад и существующий до наших дней. Следует учитывать, что в современных системах классификации птицы также относятся к диапсидам. Ныне в мире насчитывается более 22 000 видов диапсид, включая птиц.

Ана́псиды (лат. Anapsida) — полифилетическая группа пресмыкающихся, череп большинства из которых не имеет височных окон. Ранее считались одним из подклассов пресмыкающихся наряду с диапсидами; в современных системах классификации более не выделяются, поскольку состоят из искусственно сгруппированных вместе ветвей ранних пресмыкающихся и черепах. Помимо черепах, к анапсидам относили следующие ветви стволовых рептилий (завропсид): капториниды (Captorhinidae), парарептилии (Parareptilia) и Protorothyrididae.

Лепидоза́вры — надотряд пресмыкающихся из подкласса диапсид. Включает в себя два современных отряда: чешуйчатые и клювоголовые. Вымершие лепидозавры включают семейство мозазавров и другие группы.

Архозавроморфы (лат. Archosauromorpha) — инфракласс пресмыкающихся из подкласса диапсид. Впервые появились в поздней перми и распространились в триасе. В этот инфракласс включают непосредственно архозавров и некоторые вымершие отряды. В 1991 году была опубликована работа, в которой архозавроморфы рассматривались как клада, включающая наиболее раннего общего предка групп Prolacerta, архозавров, Trilophosaurus, Hyperodapedon и всех их потомков. В 1998 Дэвид Дилкс опубликовал работу, где сформулировал более общее определение для клады, включив в неё Protorosaurus и близких к нему диапсид.

Проколофономорфы (лат. Procolophonomorpha) — отряд парарептилий, живших во времена пермского периода предшественники ранних рептилий. Группа включала разнородных существ, от ящерицеподобных, до крупных Pareiasauridae, напоминающих лишённых панциря черепах.

Тетраподомо́рфы (лат. Tetrapodomorpha) — клада челюстноротых из группы рипидистий (Rhipidistia), которой некоторые систематики придают ранг подкласса. Включает надкласс четвероногих (Tetrapoda), а также ряд вымерших лопастепёрых рыб, более близких к наземным позвоночным, чем к двоякодышащим.

Тестудинаты (лат. Testudinata) — внеранговая клада пресмыкающихся с настоящим черепашьим панцирем. В группу включают как современных черепах (Testudines), так и множество их вымерших родственников, имевших панцири (стем-черепах). Несмотря на то, что группу впервые в систематику ввёл Яков Клейн (Klein) в 1760 году, современное определение ей дали Уолтер Джойс (Joyce) и его коллеги в 2004 году: название Testudinata относится к кладе, происходящей от первого представителя Pantestudines с полным черепашьим панцирем, который гомологичен панцирю у Chelonia mydas (Linneus, 1758). В состав тестудинат обычно не включают примитивную стем-черепаху Odontochelys, у которой был только пластрон. Признаки присутствия самых ранних представителей датируют ранним и средним триасом в виде окаменевших цепочек следов. Филогенетическое исследование 2019 года восстановило Angolachelonia и Testudines как сестринские таксоны в составе тестудинат.
Жак Арман Готье — американский зоолог и палеонтолог позвоночных. Является одним из основателей кладистики в палеонтологии.

За́врии (лат. Sauria) — группа организмов (клада) в составе диапсид, в которую включают ближайшего общего предка архозавров и лепидозавров, а также всех его потомков. Если включать в состав заврий черепах, тогда эту группу можно считать кроновой группой диапсид или рептилий в целом; Готье и Кейрош (2020) полагают, что в таком случае таксон Sauria должен считаться синонимом Reptilia, которых Лаурин и Рейш определили в качестве кроновой группы.

Archelosauria (лат.) — клада рептилий, включающая в себя черепах, архозавров и их ближайших вымерших родственников, но не лепидозавров. Большинство филогенетических анализов, основанных на молекулярных данных, подтверждают родство между черепахами и архозаврами. С другой стороны, архелозавры не были подтверждены большинством морфологических анализов, которые вместо этого обнаружили, что черепахи либо являются потомками парарептилий, рано расходящихся диапсидов, не входящих в заврий, или близкие родственники лепидозавров, не входящие в Ankylopoda.

Acerosodontosaurus (лат.) — вымерший род неодиапсидных рептилий, обитавших на Мадагаскаре в позднем пермском периоде. Единственный вид Acerosodontosaurus piveteaui известен по литой окаменелости единственного частичного скелета, включающего раздробленный череп, часть тела и конечностей. Окаменелость обнаружена в отложениях формации Нижняя Сакамена. На основе характеристик скелета высказано предположение, что особи Acerosodontosaurus хотя бы частично вели водный образ жизни.