
Ко́кса — река на юго-западе Республики Алтай, левый приток Катуни. Протекает по территории Усть-Канского и Усть-Коксинского районов.
Караган — река в России, протекает в Алтайском крае. Устье реки находится в 78 км по правому берегу реки Неня. Длина реки составляет 28 км, площадь водосборного бассейна 108 км².
Араскан — река в России, протекает по Усть-Коксинскому району Республики Алтай. Устье реки находится в 15 км от устья реки Аккем по правому берегу. Длина реки составляет 13 км.
Колбина — река в России, протекает по Усть-Коксинскому району Республики Алтай. Устье реки находится в 17 км от устья Банной по левому берегу. Длина реки составляет 13 км. Притоки — Малая Чекала, Малая Колбина.
Карагай, в верхнем течении Большой Карагай — река в России, протекает по Усть-Коксинскому району Республики Алтай. Устье реки находится в 97 км по правому берегу реки Кокса. Длина реки — 51 км, площадь водосборного бассейна — 462 км².

Карагай — река в России, протекает по Кош-Агачскому району Республики Алтай. Устье реки находится в 60 км от устья реки Бугузун по правому берегу. Длина реки составляет 17 км.
Куккарагай — река в России, протекает по Кош-Агачскому району Республики Алтай. Устье реки находится в 37 км от устья реки Джазатор по правому берегу. Длина реки составляет 12 км.

Кызылшин — река в России, протекает по Кош-Агачскому району Республики Алтай. Устье реки находится в 217 км от устья реки Чуи по правому берегу. Длина реки составляет 79 км, площадь водосборного бассейна — 1560 км².
Малый Ильгумень — река в России, протекает по Онгудайскому району Республики Алтай. Устье реки находится в 17 км от устья реки Урсул по правому берегу. Длина реки составляет 36 км.
Малая Иша́ — река в России, протекает по Майминскому и Чойскому районам Республики Алтай. Устье реки находится в 113 км от устья реки Иши по левому берегу. Длина реки составляет 53 км, площадь водосборного бассейна — 562 км².
Малый Колагаш — река в России, протекает по Усть-Коксинскому району Республики Алтай. Устье реки находится в 5 км от устья Большого Колагаша по правому берегу. Длина реки составляет 14 км.
Малый Сугаш — река в России, протекает по Усть-Коксинскому району Республики Алтай. Устье реки находится в 522 км от устья Катуни по правому берегу. Длина реки составляет 16 км.
Малый Улужай — река в России, протекает по Усть-Канскому району Республики Алтай. Устье реки находится в 8 км от устья реки Улужай по правому берегу. Длина реки составляет 15 км.
Малая Катанда — река в России, протекает по Усть-Коксинскому району Республики Алтай. Устье реки находится в 444 км от устья Катуни по левому берегу. Длина реки составляет 27 км.
Паспаул — река в России, протекает по Чойскому району Республики Алтай. Устье реки находится в 19 км от устья Малой Иши по левому берегу. Длина реки составляет 16 км.
Тюдет — река в России, протекает в Усть-Коксинском районе Республики Алтай. Устье реки находится в 26 км по правому берегу реки Кокса. Длина реки составляет 16 км. Притоки: Большой Тюдет, Малый Тюдет, Фирсиха,
Учек — река в России, протекает в Республике Алтай. Устье реки находится в 16 км по правому берегу реки Малая Иша. Длина реки составляет 23 км. В 11 км от устья, по левому берегу реки впадает река Карым
Оленджулар — река в России, протекает по Кош-Агачскому району Республики Алтай. Устье реки находится в 8 км от устья реки Карагай по левому берегу. Длина реки составляет 12 км.

Текелю — река в России, протекает по Кош-Агачскому району Республики Алтай. Устье реки находится в 4 км от устья реки Карагай по левому берегу. Длина реки составляет 19 км.
Ярлык — река в России, протекает в Республике Алтай. Устье реки находится в 13 км по правому берегу реки Карагай. Длина реки составляет 11 км.