
Окина́ва (яп. 沖縄県 Окинава-кэн, на окинавском языке — Утина:-кэн) — самая южная префектура Японии, которая состоит из сотен малых островов, образующих архипелаг Рюкю протяженностью более 1000 км. Площадь префектуры составляет 2276,49 км², население — 1 411 964 человека, плотность населения — 620,24 чел./км².

Би́ва (яп. 琵琶湖 Бива-ко), раньше называлось Оми, в русскоязычных источниках также Мизууми, от мидзууми (яп. 湖, «озеро») — крупнейшее озеро Японии, находящееся в префектуре Сига, к северо-востоку от бывшей столицы Киото. Пресноводное, имеет тектоническое происхождение. Часто упоминается в японской литературе, так как находится близко к древней столице. Про это озеро складывались стихи, с ним связаны многочисленные битвы. По преданию, название озера происходит от музыкального инструмента бива из-за сходства очертаний с формой этого инструмента.

Йо́до, Йодо-Гава (яп. 淀川 ёдогава) — река на острове Хонсю, Япония. Протекает по территории префектур Сига, Киото и Осака. Длина реки 75 км, площадь бассейна 8240 км². На территории бассейна реки проживает около 11 млн человек, что составляет около 9 % населения Японии и более половины населения региона Кансай.

На́ха (яп. 那覇市 Наха-си) — центральный город, административный центр и крупнейший город префектуры Окинава Японии. Расположен в южной части острова Окинава, на побережье Восточно-Китайского моря.

Тоне или Тонегава (яп. 利根川 тонэ-гава) — река в Японии, протекает по территории региона Канто.

Сина́но, или Синано-Гава (яп. 信濃川), в префектуре Нагано — Тикума или Тикума-Гава (яп. 千曲川), протекающая на острове Хонсю, — самая длинная из рек Японии и первая по расходу воды. Её протяжённость — 367 км, на территории её бассейна проживает почти три миллиона человек. Протекает по территории префектур Ниигата и Нагано через города Нагано и Нагаока и впадает в Японское море в порту Ниигата. По площади бассейна Синано занимает третье место после Тоне и Исикари. Согласно японской классификации, Синано является рекой первого класса.

Тенрю (яп. 天竜川 тэнрю:-гава) — река в Японии. Её длина — 213 км, площадь водосбора — 5090 км².

И́се, Исе-ван (яп. 伊勢湾 исэ-ван, «залив Исе») или И́сеноу́ми (яп. 伊勢海 исэ-но-уми, «море Исэ») — залив Филиппинского моря в Японии, вдается в южное побережье центральной части острова Хонсю. Расположен в прибрежных водах префектур Айти и Миэ. С запада, севера и востока окружён полуостровами Сима, Тита и Ацуми. На севере в залив впадают реки Кисо, Нагара, Иби и Сёнай. На юго-востоке сообщается с заливом Микава через пролив Накаяма.

По официальным данным 2019 года в Японии насчитывается 21 147 рек.

Тофуцу — лагунное озеро на востоке японского острова Хоккайдо. Располагается на территории округа Охотск в префектуре Хоккайдо. Относится к бассейну Охотского моря, сообщаясь с ним на северо-западе через протоку, впадающую в залив Абасири. Вместе с озёрами Ноторо, Абасири и Сарома входит в состав квазинационального парка Абасири.

Хии (яп. 斐伊川 хиикава, варианты написания: Хиикава, Хии-Гава) — река в Японии на острове Хонсю. Протекает по территории префектур Тоттори и Симане через города Идзумо и Мацуэ и через озёра Синдзи и Накауми, и впадает в Японское море. Хии является крупнейшей рекой на востоке префектуры Симане. Длина реки составляет 153 км, площадь бассейна — 2540 км².

Залив Микава, Бухта Микава (яп. 三河湾 микава-ван) — полузакрытый залив, мелкий эстуарий в Японии на тихоокеанском побережье центральной части острова Хонсю. В залив впадают реки Яхаги и Тоё.

Тега-Нума (яп. 手賀沼 тэганума) — пресноводное озеро в центральной части японского острова Хонсю. Располагается на северо-западе префектуры Тиба.

Ураути (яп. 浦内川 ураутигава) — река в Японии на острове Ириомоте. Протекает по территории префектуры Окинава.

Яцусиро (яп. 八代海 яцусиро-кай, «Море Яцусиро») — закрытый залив на западе Кюсю, на японском побережье Восточно-Китайского моря, расположен в префектурах Кагосима и Кумамото.

Кокуба (яп. 国場川 кокубагава) — река в Японии на острове Окинава. Длина реки составляет 11,25 км, площадь бассейна — 43,06 км².

Вага (яп. 和賀川 Вага-гава ) — река в Японии на острове Хонсю, протекает по территории префектуры Ивате. Длина реки — 80 км. Площадь водосборного бассейна — 890 км².

Накама (яп. 仲間川 накамагава) — река в Японии на острове Ириомоте. Протекает по территории префектуры Окинава.

Хендза или Хендза-дзима (яп. 平安座島 хэндза-дзима) — островок в архипелаге Рюкю, расположенный восточнее острова Окинава. Его площадь составляет 5,32 км². Население — 1391 человек (2005). Длина береговой линии составляет 7 км.

Кодзима или Кодзима-ко (яп. 児島湖 кодзима-ко, «озеро Кодзима») — водохранилище в Японии на острове Хонсю, на юге префектуры Окаяма, на побережье Внутреннего Японского моря. На юге омывает полуостров Кодзима.