Бакте́рии — домен прокариотических микроорганизмов. Бактерии обычно достигают нескольких микрометров в длину, их клетки могут иметь разнообразную форму: от шарообразной до палочковидной и спиралевидной. Бактерии — одна из первых форм жизни на Земле и встречаются почти во всех земных местообитаниях. Они населяют почву, пресные и морские водоёмы, кислые горячие источники, радиоактивные отходы и глубинные слои земной коры. Бактерии часто являются симбионтами и паразитами растений и животных. Большинство бактерий к настоящему времени не описано, и представители лишь половины отделов бактерий могут быть выращены в лаборатории. Бактерии изучает наука бактериология — раздел микробиологии.
Helicobacter pylori (лат.) — спиралевидная грамотрицательная бактерия, которая инфицирует различные области желудка и двенадцатиперстной кишки. Многие случаи язв желудка и двенадцатиперстной кишки, гастритов, дуоденитов, рака желудка и, возможно, некоторые случаи лимфом желудка этиологически связаны с инфекцией Helicobacter pylori. Однако у большинства инфицированных носителей Helicobacter pylori не обнаруживается никаких симптомов заболеваний.
Аэро́бы — организмы, которые нуждаются в свободном молекулярном кислороде для процессов синтеза энергии, в отличие от анаэробов. К аэробам относятся подавляющее большинство животных, все растения, а также значительная часть микроорганизмов.
Анаэробы — организмы, получающие энергию при отсутствии доступа кислорода путём субстратного фосфорилирования, конечные продукты неполного окисления субстрата при этом могут быть окислены с получением большего количества энергии в виде АТФ.
Круговорот азота — биогеохимический цикл азота. Большая его часть обусловлена действием живых существ. Важную роль в круговороте играют почвенные микроорганизмы, обеспечивающие азотистый обмен почвы — круговорот в почве азота, который присутствует там в виде простого вещества (газа — N2) и ионов: нитритов (NO2-), нитратов (NO3-) и аммония (NH4+). Концентрации этих ионов отражают состояние почвенных сообществ, поскольку на эти показатели влияет состояние биоты (растений, микрофлоры), состояние атмосферы, вымывание из почвы различных веществ. Они способны снижать концентрации азотсодержащих веществ, губительные для других живых организмов. Они могут переводить токсичный для живых существ аммиак в менее токсичные нитраты и в биологически инертный атмосферный азот. Таким образом, микрофлора почвы способствует поддержанию стабильности её химических показателей.
Грамотрица́тельные бакте́рии — бактерии, которые не окрашиваются кристаллическим фиолетовым при использовании окраски микроорганизмов по методу окрашивания по Граму. В отличие от грамположительных бактерий, которые сохраняют фиолетовую окраску даже после промывания обесцвечивающим растворителем (спирт), грамотрицательные полностью обесцвечиваются. После промывания растворителем при окрашивании по Граму добавляется контрастный краситель, который окрашивает все грамотрицательные бактерии в красный или розовый цвет. Это происходит из-за относительно небольшой толщины клеточной стенки. Сам по себе тест полезен при классификации бактерий и разделении их на две группы относительно строения их клеточной стенки. Из-за своей более мощной и непроницаемой клеточной стенки грамотрицательные бактерии более устойчивы к антителам, чем грамположительные.
Кларитромицин (Clarithromycin) — лекарственное средство, антибиотик, макролид, производное эритромицина, используется для лечения бактериальной инфекции. Это включает, среди прочего, стрептококковое горло, пневмонию, кожные инфекции, инфекцию H. pylori и болезнь Лайма. Кларитромицин можно принимать внутрь в виде таблеток или жидкости.
Диритромицин является полусинтетическим 14-членным антибиотиком-макролидом, продуктом конденсации эритромициламина и метоксиацетальдегида. Представляет собой С9-оксазиновое производное эритромициламина, близкого по структуре к эритромицину.
Трансформа́ция — процесс поглощения бактериальной клеткой молекулы ДНК из внешней среды. Для того, чтобы быть способной к трансформации, клетка должна быть компетентной, то есть молекулы ДНК должны иметь возможность проникнуть в неё через клеточные покровы. Трансформация активно используется в молекулярной биологии и генетической инженерии.
Протеобактерии — наиболее многочисленная группа бактерий — 1534 вида или примерно треть от всех известных видов бактерий.
Аэротенк — чаще всего резервуар прямоугольного сечения, по которому протекает сточная вода, смешанная с активным илом, где происходит биохимическая очистка сточной воды. Воздух, вводимый с помощью пневматических или механических аэраторов — аэрационной системы, перемешивает обрабатываемую сточную воду с активным илом и насыщает её кислородом, необходимым для жизнедеятельности бактерий. Большая насыщенность сточной воды активным илом и непрерывное поступление кислорода обеспечивают интенсивное биохимическое окисление органических веществ, поэтому аэротенки являются одним из наиболее совершенных сооружений для биохимической очистки. В зависимости от требуемой степени снижения органического загрязнения сточных вод аэротенки проектируются на полную биологическую очистку и неполную очистку.
Кише́чная па́лочка — вид грамотрицательных палочковидных бактерий, широко распространённых в нижней части кишечника теплокровных животных. Большинство штаммов E. coli являются безвредными, однако серотип O157:H7 может вызывать тяжёлые пищевые отравления у людей и животных. Безвредные штаммы являются частью нормальной флоры кишечника человека и животных. Кишечная палочка приносит пользу организму хозяина, например, синтезируя витамин K, а также предотвращая развитие патогенных микроорганизмов в кишечнике.
Энтерококки — род бактерий из семейства Enterococcaceae, является типовым родом семейства.
Малигниза́ция — приобретение клетками нормальной или патологически изменённой ткани организма свойств злокачественной опухоли. В основе малигнизации лежат нарушения процессов дифференцировки и пролиферации клеток. Малигнизация является следствием накопления мутаций и утратой механизма репарации ДНК в клетках, а также нарушения механизмов апоптоза - запрограммированной клеточной гибели, необходимой для нормального функционирования всего организма.
Боррелии — род бактерий семейства Spirochaetaceae порядка спирохет. Представители рода являются возбудителями таких заболеваний человека, как боррелиозы, преимущественно зооантропонозного характера с трансмиссивным путём передачи возбудителя. Род насчитывает 54 различных вида.
Амоксицилли́н — лекарственное средство, полусинтетический антибиотик широкого спектра действия группы пенициллинов для лечения бактериальных инфекции. Его принимают внутрь или, реже, путём инъекции.
Зона кислородного минимума (ЗКМ), иногда называемая затенённая зона — это зона, в которой содержание кислорода в морской воде минимально. Эта зона расположена на глубинах от 200 до 1000 метров в зависимости от местных условий. ЗКМ широко распространены, обычно вдоль западных побережий континентов, в областях, где взаимодействие физических и биологических процессов одновременно понижает концентрацию и ограничивает перемешивание воды, создавая слой воды, в котором концентрация кислорода падает с нормальных 4-6 мг/л до 2 мг/л и ниже.
Нанаэробы — организмы, которые не способны расти в присутствии микромолярных концентраций кислорода, однако могут расти и извлекать выгоду при наличии еще более низких наномолярных концентраций кислорода. Как и другие анаэробы, нанаэробы не нуждаются в кислороде для роста, т.е. нанаэробы являются факультативными анаэробами. Преимущество роста при наличии следовых количеств кислорода требует наличия особой кислородной дыхательной цепи, которая как правило характерна для микроорганизмов с микроаэрофильным дыханием. Недавние исследования показывают, что дыхание в сверхнизких концентрациях кислорода является очень древним процессом, который предшествовал возникновению кислородного фотосинтеза.
Lactobacillus paracasei (лат.) — грамположительный вид молочнокислых бактерий, который используется в ферментации молочных продуктов. В организме человека встречается преимущественно в кишечнике и в ротовой полости. К настоящему времени известны 34 штамма L.paracasei. Шестнадцать из этих штаммов были выделены из молочных продуктов, десять из растений и восемь из желудочнокишечного тракта человека и животных. L. paracasei отличается от Lactobacillus casei и Lactobacillus rhamnosus характерным профилем ферментации различных субстратов. Определенные штаммы L. paracasei, характеризующиеся повышенной устойчивостью к воздействию среды желудка и кишечника используются в клинической практике как пробиотики.
