
Би́ва (яп. 琵琶湖 Бива-ко), раньше называлось Оми, в русскоязычных источниках также Мизууми, от мидзууми (яп. 湖, «озеро») — крупнейшее озеро Японии, находящееся в префектуре Сига, к северо-востоку от бывшей столицы Киото. Пресноводное, имеет тектоническое происхождение. Часто упоминается в японской литературе, так как находится близко к древней столице. Про это озеро складывались стихи, с ним связаны многочисленные битвы. По преданию, название озера происходит от музыкального инструмента бива из-за сходства очертаний с формой этого инструмента.

Йо́до, Йодо-Гава (яп. 淀川 ёдогава) — река на острове Хонсю, Япония. Протекает по территории префектур Сига, Киото и Осака. Длина реки 75 км, площадь бассейна 8240 км². На территории бассейна реки проживает около 11 млн человек, что составляет около 9 % населения Японии и более половины населения региона Кансай.

Эрхай — горное озеро в китайской провинции Юньнань. Высота — 1974 м над уровнем моря. Размеры составляют 42,5 км (юг-север) на 6,3 км, площадь — 250 км². Озеро занимает второе место в провинции и седьмое в стране по площади и объёму. Из озера вытекает река Фыншуйцзян.

Касумига́ура (яп. 霞ヶ浦 ) или Нисиура (яп. 西浦, «западное озеро») — лагунное озеро в Японии, находится в префектуре Ибараки региона Канто. Касумигаура является вторым по величине внутренним озером Японии.

Масю — бессточное кратерное озеро в восточной части японского острова Хоккайдо. Располагается на территории округа Кусиро в префектуре Хоккайдо. Входит в состав национального парка Акан.

Инава́сиро — четвёртое по величине озеро Японии, располагается в центральной части префектуры Фукусима на острове Хонсю. Акватории озера является охраняемой природной территорией и входит в состав национального парка Бандай-Асахи.

И́се, Исе-ван (яп. 伊勢湾 исэ-ван, «залив Исе») или И́сеноу́ми (яп. 伊勢海 исэ-но-уми, «море Исэ») — залив Филиппинского моря в Японии, вдается в южное побережье центральной части острова Хонсю. Расположен в прибрежных водах префектур Айти и Миэ. С запада, севера и востока окружён полуостровами Сима, Тита и Ацуми. На севере в залив впадают реки Кисо, Нагара, Иби и Сёнай. На юго-востоке сообщается с заливом Микава через пролив Накаяма.

Тадзава — кратерное озеро в Японии.

Тоя — кратерное озеро в Японии, расположенное на территории национального парка Сикоцу-Тоя в юго-западной части острова Хоккайдо.

Накауми — солоноватое лагунное озеро на севере юго-западной части японского острова Хонсю. Располагается на границе префектур Симане и Тоттори. Относится к бассейну Японского моря, сообщаясь с ним на северо-востоке через пролив Накаэносето (Сакай), впадающий в бухту Михо.

Синдзи — солоноватое озеро лагунного происхождения на севере юго-западной части японского острова Хонсю. Располагается на территории префектуры Симане. Относится к бассейну Японского моря, сообщаясь с ним на северо-востоке через канал Сада-Гава, впадающий в бухту Этомо. Седьмое по площади озеро Японии.

Аба́сири — солоноватое озеро лагунного происхождения на востоке японского острова Хоккайдо. Располагается на территории округа Охотск в префектуре Хоккайдо. Относится к бассейну Охотского моря, сообщаясь с ним через реку Абасири на северо-востоке, впадающую в залив Абасири. Вместе с озёрами Ноторо, Тофуцу и Сарома входит в состав квазинационального парка Абасири. В озеро впадают реки Абасири, Мемамбецу и Томаппу.

Дзюсан или Дзюсан-Ко (яп. 十三湖 дзю:сан-ко) — солоноватое лагунное озеро западного побережья полуострова Цугару на севере японского острова Хонсю. Располагается на территории префектуры Аомори. Относится к водосборному бассейну Японского моря, сообщаясь с ним через пролив шириной 250 м на северо-западе. В 1959 году через пролив был перекинут деревянный мост, в 1979 заменён на бетонный.

Су́ва — пресноводное горное озеро в центре средней части японского острова Хонсю. Располагается между городами Окая и Сува, на территории префектуры Нагано. Относится к водосборному бассейну Филиппинского моря. Сток из озера идёт на запад через реку Тенрю в залив (плёс) Энсю-Нада.

Тюдзендзи — пресноводное горное озеро на северо-востоке центральной части японского острова Хонсю. Располагается на территории префектуры Тотиги. Входит в состав национального парка Никко. Относится к бассейну реки Тоне. Сток из озера идёт на восток через реку Дайя, впадающую в Кину.

Хии (яп. 斐伊川 хиикава, варианты написания: Хиикава, Хии-Гава) — река в Японии на острове Хонсю. Протекает по территории префектур Тоттори и Симане через города Идзумо и Мацуэ и через озёра Синдзи и Накауми, и впадает в Японское море. Хии является крупнейшей рекой на востоке префектуры Симане. Длина реки составляет 153 км, площадь бассейна — 2540 км².

Залив Кодзима (яп. 児島湾 кодзима-ван) — залив на севере Внутреннего Японского моря, расположен в префектуре Окаяма. В залив впадают реки Асахи и Ёсии и канал Хяккэн.

Тега-Нума (яп. 手賀沼 тэганума) — пресноводное озеро в центральной части японского острова Хонсю. Располагается на северо-западе префектуры Тиба.

Вага (яп. 和賀川 Вага-гава ) — река в Японии на острове Хонсю, протекает по территории префектуры Ивате. Длина реки — 80 км. Площадь водосборного бассейна — 890 км².

Кодзима или Кодзима-ко (яп. 児島湖 кодзима-ко, «озеро Кодзима») — водохранилище в Японии на острове Хонсю, на юге префектуры Окаяма, на побережье Внутреннего Японского моря. На юге омывает полуостров Кодзима.