
Котло́вка — река в Юго-Западном административном округе Москвы, третий по величине в городе правый приток Москвы-реки. Частично заключена в подземный коллектор, в открытом русле протекает в среднем течении. По правому берегу Котловки довольно далеко от верховья располагалось село Зюзино, возле устья — село Котёл, а позднее — деревни Верхние- и Нижние Котлы. С 1991 года фрагмент долины Котловки, который примыкает к Коробковскому саду, имеет статус памятника природы регионального значения.
Купание в реке запрещено. Котловка и такие реки, как Яуза, Филька и Пресня, относятся к одним из самых загрязнённых рек Москвы, так как в них многократно превышены предельно допустимые концентрации содержания нефтепродуктов, фенолов, хлоридов и солей тяжёлых металлов.
Се́тунька — малая река на западе Москвы, значительный правый приток Сетуни, является вторым водотоком по длине и мощности в Солнцеве.

Ка́менка — река в Северо-Восточном административном округе Москвы, правый приток Яузы. Частично заключена в подземный коллектор. Название Каменка характерно для рек с каменистым руслом. К югу от улицы Академика Комарова по правому берегу реки находился Кашёнкин луг, от которого Каменка получила название Кашенка. Приустьевый участок Каменки является прежним руслом Яузы.

Жа́бенка — река в Тимирязевском районе Северного административного округа Москвы, правый приток Лихоборки. Своё название получила от слова «жаба». Речное русло частично заключено в подземный коллектор. Вода Жабенки загрязнена нефтепродуктами и солями тяжёлых металлов. Левым притоком реки является Коптевский ручей, правым — Фермерский ручей.

Конько́вский руче́й — малая река на юге Москвы, на территории района Коньково и Битцевского леса Юго-Западного административного округа Москвы, левый приток Чертановки. Частично протекает в подземном коллекторе.
Ольша́нка — ручей в районах Лианозово и Бибирево Северно-Восточного административного округа Москвы, правый приток Чермянки. Водоток практически на всём протяжении заключён в подземный коллектор. По степени техногенной трансформации река относится к III классу — в открытом течении проходит на 10—49%, русло сильно трансформировано.

Жу́жа — река в районах Нагатино-Садовники и Нагатинский Затон Южного административного округа Москвы, правый приток Москвы-реки. Речное русло канализировано более чем на 90 %. Правым притоком реки является ручей Савкин овраг.
Ра́чка — малая река в Басманном и Таганском районах Центрального административного округа Москвы, правый приток Яузы и бывший левый приток Москвы-реки. В 1740 году во время разлива Рачка затопила церковь Троицы на Грязех. В 1750-м архитектор Дмитрий Ухтомский подготовил проект заключения реки в коллектор. В 1759 году речное русло канализировали. В XIX веке приустьевую часть коллектора перенаправили в Яузу. По степени техногенной трансформации Рачка относится к IV классу — река заключена в коллектор, поверхностный водоток утрачен.

Вавило́н — ручей в районе Хамовники Центрального административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. Низовья засыпаны, верховья убраны в подземный коллектор.
Золото́й Рожо́к — малая река в районе Лефортово Юго-Восточного административного округа города Москвы, левый приток Яузы. С 1935 года протекает в подземном коллекторе. На правом берегу ручья расположена усадьба Строгановых. От гидронима ручья произошли названия: Золоторожская набережная, Золоторожская улица, Золоторожский Вал, Верхний Золоторожский переулок, Средний Золоторожский переулок и Золоторожский проезд.
Ка́пля (Ка́пелька) — ручей в Мещанском районе Центрального административного округа Москвы, левый приток Напрудной. Водоток проходит в подземном коллекторе.

Кровя́нка — водоток в Гагаринском и Донском районах Юго-Западного административного округа Москвы, левый приток Чуры. Речное русло в 1955—1961 годах было частично заключено в подземный коллектор.
Ермако́вский руче́й — малая река в Пресненском районе Центрального административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. Речное русло заключено в подземный коллектор. Правым притоком является ручей Камушки. В 2008 году при строительстве делового центра «Москва-Сити» коллектор ручья был реконструирован.
Журавенка — река в Москве и Московской области, левый приток Битцы. Исток расположен в районе Бирюлёво Восточное Южного административного округа Москвы, устье — в Ленинском районе Московской области на территории городского поселения Видное. Является самым крупным притоком Битцы, в бассейне Журавенки находится 8 водоёмов. Правыми притоками реки являются овраги Никольский, Суслов и Гузеев.
Руче́й Ва́тной фа́брики — небольшая река в районах Измайлово и Северное Измайлово Восточного административного округа Москвы, правый приток Серебрянки. По степени техногенной трансформации относится к IV классу — поверхностный водоток утрачен, река канализирована более чем на 90 %. На берегах реки располагались село Измайлово и слободы Калгановская, Попова, Хохловская и Штатная.
Дани́ловский ручей (Дани́ловка, Худе́ница) — малая река Южного административного округа Москвы в бывшей Даниловской слободе, правый приток Москвы-реки. Своё название получил от Данилова монастыря, вдоль которого проходил водоток. Гидроним «Худеница» возник по урочищу, которое располагалось на этой территории. По состоянию на начало 2018 года заключён в подземный коллектор.
Лео́новский ручей — малая река в районах Свиблово и Ростокино Северо-Восточного административного округа Москвы, левый приток Яузы. Длина реки составляет 2,6 км. Первый гидроним произошёл от села и усадьбы Леоново, второй — от урочища Высково. Леоновским ручьём ошибочно называли реку Будайку и слив с Капустянского пруда. По состоянию на начало 2018 года почти целиком заключён в подземный коллектор.
Плинто́вка — малая река в районе Капотня Юго-Восточного административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. Своё название получила от географического термина «плинтовка», который означает «участок пахотной земли на болоте». Речное русло заключено в подземный коллектор. По сообщению диггеров, вода Плинтовки сильно загрязнена нефтепродуктами. Питание реки осуществляется за счёт её притоков — Лесного и Среднего ручьёв.
Угре́шский руче́й — малая река в районе Печатники Юго-Восточного административного округа Москвы, правый приток Нищенки. Водоток проходит в подземном коллекторе. Своё название река получила от Угрешской улицы и одноимённых проездов.

Ю́жный Октя́брьский руче́й — малая река в районе Хорошёво-Мнёвники Северо-Западного административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки.