
Негли́нная — река в центре Москвы, левый приток реки Москвы. Длина 7,5 км, почти на всём протяжении заключена в трубу. Река дала названия многим московским улицам, площадям и станциям метро: Неглинная улица, Кузнецкий Мост и станция метро «Кузнецкий Мост», Трубная улица, станция метро «Трубная» и Трубная площадь, Самотёчная улица и Самотёчная площадь и пр. С Неглинной связаны многие наводнения в Москве.
В пределах МКАД находятся около 150 малых рек и ручьёв, а также около 240 открытых водоёмов. Большинство малых рек в черте города заключены в коллекторы.

Ма́лый Патриа́рший переу́лок — небольшая улица в центре Москвы у Патриарших прудов на Пресне между Большим Патриаршим и Ермолаевским переулками.

Пруд Алту́фьевского района — искусственный водоём в Алтуфьевском районе Северо-Восточного административного округа города Москвы. Расположен на пересечении Инженерной улицы с Алтуфьевским шоссе.

Фи́лька — река на западе Москвы, правый приток реки Москвы, почти на всём своём протяжении заключённая в подземный коллектор. Общая длина — около 10 км, площадь водосборного бассейна — 13 — 15 км².

Бори́совские пруды́ или Бори́совский пруд — искусственный водоём в пойме реки Городни в Южном административном округе Москвы. Находится на территории районов Орехово-Борисово Северное и Москворечье-Сабурово, граничит с районом Братеево. С 1998 года является частью природно-исторического парка «Царицыно».

Я́сный пруд — водоём в районе Южное Медведково Северо-Восточного административного округа Москвы. Расположен к северо-западу от пересечения проездов Ясного и Дежнёва, между домами № 1 и № 5 по Ясному проезду. Водоём устроен на исчезнувшем левом притоке реки Чермянки. Своё название получил от Ясного проезда.

Большой Садо́вый пруд (Академи́ческий) — один из крупнейших водоёмов Москвы, площадью 19 га. Расположен в Тимирязевском районе Северного административного округа, между Большой академической улицей и парком Сельскохозяйственной академии имени К. А. Тимирязева.

Сове́тский пруд — искусственный водоём Мещёрской озёрно-ледниковой низменной равнины, расположен на востоке Москвы, в юго-восточной части района и муниципального образования «Перово» Восточного административного округа. Вырыт и заполнен в начале XVIII века. Размеры — 140×60 м, площадь — 0,007 км². Длина береговой линии — 0,4 км.

Мази́ловский пруд — искусственный водоём в пойме реки Фильки, расположен в пределах территории района «Фили-Давыдково» Западного административного округа г. Москвы.

Терле́цкие пруды — каскад искусственных водоёмов на реке Серебрянке в районе Ивановское Восточного административного округа города Москвы. Состоит из пяти прудов — Северного, Восточного, Юго-Восточного, Юго-Западного и Западного. Водоёмы расположены на территории Терлецкого лесопарка в бассейне Чёрного ручья. Каскад является памятником природы, вместе с лесопарком входит в состав природно-исторического парка «Измайлово» и является особо охраняемой природной территорией.
Салтыковский овраг — водоток, протекающий в южной части Москвы, является правым притоком Битцы, куда впадает на 500—600 м выше Варшавского шоссе, между Качаловом и ВИЛАРом. Длина составляет примерно 1,6 км. Исток Салтыковского оврага расположен юго-западнее Феодосийской улицы. Русло простиралось на северо-восток через Салтыковский пруд и далее на северо-восток. В этом месте овраг частично засыпан. Пруд представляет собой декоративный водоём неправильной формы, самая широкая часть с севера на восток, площадь — 0,35 га. Набережная вымощена камнем, по берегам есть луговые откосы. Также в этом месте в овраге произрастают группы деревьев, водоём используется для рыбной ловли. Салтыковский овраг существенно изменился, но частично сберегся посреди жилой застройки. Водоток заключён в бетонную конструкцию, устье находится рядом с верхней частью Большого пруда Северного Бутова.
Рождественка — река в России, в районе Митино Москвы, правый приток Сходни. Протекает в открытом русле.

До́лгие пруды́ — каскад из двух искусственных водоёмов — Долгого и Нижнего на реке Мерянке, правом притоке Клязьмы. Находится в Северном районе Северо-Восточного административного округа Москвы. Водоёмы разделены плотиной, по которой проходит Долгопрудная аллея. Гидроним каскада произошёл от продолговатой формы, второй — от усадьбы Виноградово. Позднее по прудам были названы город Долгопрудный, Долгопрудненское шоссе, Долгопрудные улица и аллея, платформа Долгопрудная Савёловского направления Московской железной дороги.
Соловьи́ный пруд — водоём в районе Ясенево Юго-Западного административного округа Москвы, находится возле улицы Рокотова.

Пионе́рский пруд — искусственный водоём в районе Якиманка Центрального административного округа Москвы. Находится в восточной части Центрального парка культуры и отдыха имени Максима Горького рядом с улицей Крымский Вал.
Миха́йловский овраг — малая река в Москве и Московской области, левый приток Битцы. Верховья реки засыпаны, речное русло южнее МКАД трансформировано и заключено в подземный коллектор. На территории Аннинского лесопарка сохранился в открытом течении на протяжении 350 метров. Название антропонимическое.
Руза́ев овраг — малая река в районе Ясенево Юго-Западного административного округа Москвы, левый приток Битцы. Частично заключена в подземный коллектор, речное русло трансформировано, местами засыпано и застроено. В 2017 году постановлением Правительства Москвы от 5 декабря 2017 года № 961-ПП Рузаев овраг с прудом, общей площадью 0,88 га, включили в состав природного комплекса ЮЗАО Москвы. Название антропонимическое.
Садно́вский овра́г — малая река на юге Москвы, в районе Северное Бутово Юго-Западного административного округа, правый приток Битцы.
Пи́льненское водохранилище — искусственно созданный водоём на реке Ельничной, в городе Первоуральске Свердловской области России. Площадь — 0,3 км².