
Цианобакте́рии, или сине-зелёные во́доросли, или циане́и — отдел крупных грамотрицательных бактерий, способных к фотосинтезу, сопровождающемуся выделением кислорода.

Зелёные во́доросли — группа низших растений. В современной систематике эта группа имеет ранг отдела, включающего одноклеточные и колониальные планктонные водоросли, одноклеточные и многоклеточные формы бентосных водорослей. Здесь встречаются все морфологические типы слоевища, кроме ризоподиальных одноклеточных и крупных многоклеточных форм со сложным строением. Многие нитчатые зелёные водоросли крепятся к субстрату только на ранних стадиях развития, затем они становятся свободноживущими, формируя маты или шары.

Динофлагелля́ты, или динофи́товые во́доросли, или динофи́ты, или перидине́и, или па́нцирные жгутиконо́сцы — крупная группа протистов из надтипа альвеолят (Alveolata), которой традиционно присваивают ранг типа. Известно около 4000 ископаемых и более 2500 современных видов, из которых 90 % обитает в морях, остальные — в пресных водах. Около половины представителей — свободноживущие фотосинтезирующие организмы, однако известны и бесцветные гетеротрофные формы, и паразитические динофлагелляты. Некоторые виды являются симбионтами коралловых полипов и двустворчатых моллюсков.

Кра́сные во́доросли, или багря́нки — отдел водорослей, обитатели прежде всего морских водоёмов, пресноводных представителей известно немного. Обычно это довольно крупные растения, но встречаются и микроскопические. Среди красных водорослей имеются одноклеточные, нитчатые и псевдопаренхимные формы; истинно паренхимные формы отсутствуют. Ископаемые остатки свидетельствуют, что это очень древняя группа растений. Красные водоросли неоднократно переходили к паразитированию на других красных водорослях: как близкородственных (адельфопаразитизм), так и более удалённых.

Харофиты, или харофитовые водоросли — отдел водорослей из группы зелёных растений, близкий к зелёным водорослям (Chlorophyta) и высшим растениям (Embryophyta). Традиционно в составе харофитовых рассматривали только харовые водоросли, однако начиная с 1980-х годов в таксон наряду с ними включают конъюгат и несколько небольших групп водорослей, которые характеризуются формированием фрагмопласта в телофазе клеточного деления. Представители распространены преимущественно в пресных водах.

Бурые водоросли (лат. Phaeophyceae) — класс отдела охрофитовых водорослей. В жизненном цикле всех представителей присутствуют многоклеточные стадии. Бурые водоросли в хроматофорах содержат бурый пигмент фукоксантин (C40H56O6), который маскирует остальные пигменты.

Страменопилы, страминопилы, или гетероконтные, разножгутиковые организмы (лат. Heterokonta), — большая группа одноклеточных, колониальных и многоклеточных эукариотических организмов. Для фотосинтезирующих представителей характерно наличие хлорофиллов a, c1, c2, c3, а также фукоксантина или вашериоксантина. Длинный жгутик в норме покрыт трёхчастными мастигонемами (ретронемами).

Криптофи́товые во́доросли, или криптомона́ды, или криптофи́ты , — группа одноклеточных эукариотических фотосинтезирующих организмов, включающая около 165 видов, которой традиционно присваивают ранг типа. Почти все криптофитовые имеют монадную форму с дорсовентральным строением, несут два неравных жгутика. Покровы клетки представлены перипластом, имеются стрекательные структуры (эжектосомы). Хлоропласты окружены четырьмя мембранами и содержат редуцированное ядро — нуклеоморф. Основные фотосинтетические пигменты — хлорофиллы a, c2, а также каротиноиды и фикобилины. Митоз обычно открытый, без центриолей, размножение в основном — вегетативное.

Кауле́рпа — род морских зелёных водорослей из порядка бриопсидовых (Bryopsidales), выделяемый в монотипное семейство каулерповых (Caulerpaceae). Как и другие бриопсидовые, лишены межклеточных перегородок (септ), так что всё слоевище, или таллом, которое зачастую обладает внушительными размерами и причудливой формой, представляет собой единственную клетку с многочисленными ядрами. Некоторые виды этого растения способны достигать длины 2,8 м, что позволяет считать их крупнейшим одноклеточным организмом в мире.

Глаукофи́товые во́доросли, или глаукофи́ты, или глаукоцистофи́ты — небольшой древний отдел одноклеточных водорослей, включающий восемь родов и 21 вид. Глаукофиты особенно интересны своими уникальными хлоропластами (цианеллами), довольно примитивно устроенными по сравнению с хлоропластами других водорослей: они содержат слой муреина между мембранами и характеризуются множеством других свойств, присущих цианобактериям. Согласно современным представлениям, глаукофитовые водоросли обособились в отдельную группу у самого основания Archaeplastida.

Брио́псидовые, или сифо́новые — порядок зелёных водорослей из класса ульвофициевых (Ulvophyceae). Общее количество современных видов — 564. Некоторые систематики придают этому таксону ранг класса — Bryopsidophyceae.

Охрофи́товые во́доросли, или охрофи́ты , — клада одноклеточных, колониальных и многоклеточных водорослей, относящихся к страменопилам (Stramenopiles), или гетероконтам (Heterokonta). Классифицируются как отдел Ochrophyta или Heterokontophyta, либо как подотдел Ochrophytina в составе отдела Gyrista.

Конъюга́ты, или сцеплянки, или зигнемофициевые, — класс водорослей из отдела Харофиты.

Хламидомона́довые, или во́львоксовые , — порядок зелёных водорослей из класса хлорофициевых. Насчитывают свыше 2000 видов в 26 семействах.

Циани́диум — род примитивных ацидотермофильных красных водорослей. Описан один общепризнанный вид — цианидиум тепличный.

Катаблефари́ды — отряд родственных криптомонадам гетеротрофных протистов. Встречаются морские и пресноводные формы. По состоянию на 2015 год описаны 10 видов в составе 5 родов.

Хлорарахниофи́товые во́доросли — клада морских одноклеточных водорослей, входящая в состав группы церкозоев, которым в последних работах систематиков присваивают ранг класса и типа соответственно. Распространены в морях тропического и умеренного поясов. Для организмов этой группы характерно наличие четырёхмембранных хлоропластов, в перипластидном пространстве которых находится нуклеоморф — редуцированное ядро эндосимбиотического эукариота. Хлорарахниофитовые водоросли — миксотрофы, они содержат хлорофиллы a и b и способны к фаготрофному питанию. Размножаются вегетативным и бесполым путём, у некоторых описан половой процесс. По последним данным, клада содержит 14 видов в 8 родах.

Анфельтия, или анфельция , — род красных водорослей семейства Анфельтиевые (Ahnfeltiaceae) из класса Флоридеевые водоросли (Florideophyceae). Около десяти видов, распространённых в северной части Атлантического и Тихого океана, а также в некоторых регионах Северного Ледовитого океана. Источник высококачественного агар-агара.

Нуклеомо́рф, или нуклеомо́рфа — маленькое рудиментарное ядро, находящееся между внешней и внутренней парами мембран в пластидах криптофитовых и хлорарахниофитовых водорослей. Они получили нуклеоморфы независимо друг от друга: от зелёной водоросли в случае хлорарахниофитовых и от красной водоросли в случае криптофитовых водорослей. Нуклеоморфы представляют собой остатки ядер зелёной и красной водорослей, поглощённых более крупным эукариотом.

Мастигоне́мы — тонкие придатки жгутика некоторых эукариотических клеток. Имеют разнообразное строение и размеры. Служат для улучшения сцепления жгутика со средой. Своеобразные мастигонемы страменопил приводят к движению клетки в обратном направлении по сравнению с такой же клеткой без мастигонем.