Барка — река в России, протекает по Щетинскому сельском поселении Череповецкого района Вологодской и Пошехонском району Ярославской области. Длина реки составляет 14 км.
Вая — река в России, протекает по Ярославской области. Исток реки находится на водоразделе Чеснавы и Волги, к востоку от деревни Ванинское. Длина реки составляет 18 км. Площадь водосборного бассейна — 84,2 км².
Верекса — река в России, протекает по Ярославской области. Исток реки находится в болоте урочище Балохонское к югу от деревни Малые Новинки. Река течёт в южном направлении. Правые притоки — Шимаровка, Пречиста. Устье реки находится в 79 км по левому берегу реки Сить. Длина реки составляет 54 км. Площадь водосборного бассейна — 219 км².
Воля — река в России, протекает по Рыбинскому району Ярославской области. Исток реки находится к югу от деревни Кузнецово, река течёт на север, а после деревни Кузнецово поворачивает на северо-запад, протеккает через Большое Погорелово, вблизи Милюшино и около деревни Костино впадает в водохранилище. Устье реки находится по левому берегу Рыбинского водохранилища, ниже (южнее) устья реки Ухра и выше (севернее) устья ручья Татьянка. Длина реки составляет 12 км.
Восломка — река в России, протекает по Рыбинскому и Пошехонскому районам Ярославской области, по границе Рыбинского и Пошехонского районов, приток реки Ухра. Длина реки составляет 14 км.
Ега — река в России, протекает по Пошехонскому району Ярославской области. Длина реки составляет 17 км. Площадь водосборного бассейна — 55,4 км².
Кисома Глухая — река в России, протекает по Пошехонскому району Ярославской области. Правый приток Согожи.
Конглас — река в России, протекает по Ярославской области. Исток реки находится около деревни Малые Ночевки. Река течёт в основном на юг, отклоняясь сначала к западу, а затем к востоку. Населённые пункты по пути реки: Соловьево, Сергеевское, Ивахово, Бобылино, Федякино. Устье реки находится в 60 км по правому берегу реки Ухра, между деревнями Ладейки и Слобода. Длина реки составляет 21 км.
Малый Южок — река в России, протекает по Череповецкому району Вологодской области. Река впадает в Рыбинское водохранилище, Шекснинский русловой участок по левому берегу. Длина реки составляет 19 км. Площадь водосборного бассейна — 60,4 км².
Мачевка — река в России, протекает по Череповецкому району Вологодской области. Исток реки находится к северу от деревни Мачево. Протекает у деревни Старики. Устье реки находится в 42 км по правому берегу реки Большой Юг, между деревнями Байново и Верховье. Длина реки составляет 11 км.
Нахта — река в России, протекает по Рыбинскому району Ярославской области. Исток реки находится в сети мелиоративных канав к северо-востоку от деревни Большие Мхи. Река течёт на северо-запад по лесной ненаселённой местности, через урочище Ладыгино, около 9 км. Первый населённый пункт на реке по правому берегу — деревня Косково. Река меняет направление на западное, в деревне Огарково, центре сельского поселения, она пересекает дорогу Р104 на участке Рыбинск-Пошехонье. Далее около 4 км она течёт по лесной местности и впадает в Рыбинское водохранилище, примерно в 2 км южнее (ниже) реки Демидовская и в 5 км севернее реки Вонготня. Длина реки составляет 17 км.
Нелаза — река в России, протекает в северо-западном пригороде города Череповец Вологодской области. Длина реки составляет 22 км, площадь водосборного бассейна — 50,9 км².
Охотка — река в России, протекает в Шекснинском районе Вологодской области. Устье реки находится в 26 км по правому берегу реки Угла. Длина реки составляет 14 км.
Репа — река в России, протекает в основном в Ярославской области. Длина реки — 47 км, площадь ещё водосборного бассейна — 423 км².
Судьбица — река в России, протекает в Череповецком и Шекснинском районах Вологодской области. Исток находится на северо-восточном склоне возвышенности, на которой находится деревня Жаворонково. Протекает на северо-запад мимо деревень Новая Деревня, Пронино, Вакарино, Кузьминское, через урочища Дуброво-Карповское, Дуброво-Григорьевское, огибает с севера урочище Большой Камень. Устье реки находится по левому берегу залива Рыбинского водохранилища, образовавшегося по руслу Шексны, между устьями рек Большой Юг и Судебка. Длина реки составляет 17 км.
Угла — река в России протекает по территории Шекснинского района Вологодской области, впадает по левому берегу в Шекснинский русловый участок Рыбинского водохранилища. Длина реки составляет 62 км. Площадь водосборного бассейна — 512 км².
Харенец — река в России, протекает по Рыбинскому району Ярославской области. Устье реки находится в Рыбинском водохранилище. Длина реки составляет 11 км.
Чимсора — река в России, протекает по территории Ягницкого сельского поселения Череповецкого района Вологодской области, большей частью по территории Дарвинского заповедника. Длина реки составляет 21 км.
Чистовка — река в России, протекает по Череповецкому району Вологодской области. Устье реки находится в Рыбинском водохранилище между древнями Большая Новинка и Максаково. Протекает мимо деревень Малая Новинка, Фролклвл, Ершово, Быково. Правые притоки — Лазаревка и Шардомка. Длина реки составляет 10 км.
Чёбсара — река в России, протекает в Вологодском и Шекснинском районах Вологодской области. Устье реки находится в 20 км по правому берегу реки Угла. Длина реки составляет 21 км.