
Лихобо́рка — река в Северном и Северо-Восточном административных округах города Москвы, правый приток реки Яузы.
В пределах МКАД находятся около 150 малых рек и ручьёв, а также около 240 открытых водоёмов. Большинство малых рек в черте города заключены в коллекторы.

Серебря́нка — река в Восточном административном округе Москвы, левый исток Хапиловки. В прошлом считалась левым и самый крупным притоком Сосенки. По степени техногенной трансформации Серебрянка относится ко II классу — на поверхности находится около 50—90 % водотока, русло умеренно трансформировано.

Ка́менка — река в Северо-Восточном административном округе Москвы, правый приток Яузы. Частично заключена в подземный коллектор. Название Каменка характерно для рек с каменистым руслом. К югу от улицы Академика Комарова по правому берегу реки находился Кашёнкин луг, от которого Каменка получила название Кашенка. Приустьевый участок Каменки является прежним руслом Яузы.

И́чка — река в Москве и Московской области России, левый приток Яузы. Большая часть водосборного бассейна находится на лесной территории национального парка «Лосиный Остров», поэтому Ичка — одна из самых чистых московских рек. Часть речной долины в 1991 году объявили памятником природы. По состоянию на 2018-й она является ландшафтным заказником «Долина реки Ички» общей площадью 81,4 га. На берегах Ички находились пустошь Свитягина и деревня Малые Мытищи. Левыми притоками реки являются ручьи Каменный и Лось.

Жа́бенка — река в Тимирязевском районе Северного административного округа Москвы, правый приток Лихоборки. Своё название получила от слова «жаба». Речное русло частично заключено в подземный коллектор. Вода Жабенки загрязнена нефтепродуктами и солями тяжёлых металлов. Левым притоком реки является Коптевский ручей, правым — Фермерский ручей.

Хапи́ловка — малая река на востоке Москвы, крупнейший приток Яузы. Образуется слиянием рек Сосенки и Серебрянки. Протекает с востока на запад по южной окраине района Преображенское; на всём своём протяжении полностью заключена в подземный коллектор. Впадает в Яузу севернее Электрозаводского моста на Преображенской набережной, почти напротив Рубцовско-Дворцовой улицы. Длина от слияния истоков до устья составляет 2,8 км.

Чечёра — правый приток реки Яузы. Длина около 4 км, полностью заключена в подземный коллектор. Исток — к северу от Ярославского вокзала. Протекает с севера на юг, вдоль Нижней Красносельской, Доброслободской улиц и Елизаветинского переулка. Современное устье — чуть ниже плотины Сыромятнического гидроузла.

Саморо́динка — малая река в районах Проспект Вернадского и Тропарёво-Никулино Западного административного округа, Обручевский Юго-Западного административного округа Москвы, правый приток Очаковки. Частично заключена в подземный коллектор, русло сильно трансформировано. В истоках Самородинки, у станции метро «Беляево», находилась деревня Беляево, на правом берегу возле устья — деревня Никольское. Долина Самородинки в 1991 году была объявлена памятником природы.
Ра́чка — малая река в Басманном и Таганском районах Центрального административного округа Москвы, правый приток Яузы и бывший левый приток Москвы-реки. В 1740 году во время разлива Рачка затопила церковь Троицы на Грязех. В 1750-м архитектор Дмитрий Ухтомский подготовил проект заключения реки в коллектор. В 1759 году речное русло канализировали. В XIX веке приустьевую часть коллектора перенаправили в Яузу. По степени техногенной трансформации Рачка относится к IV классу — река заключена в коллектор, поверхностный водоток утрачен.
Мыти́щинский во́лок из Я́узы в Кля́зьму — волок, существовавший в XII — XIV веках. Именно с него началась история образования города Мытищи.

Ни́щенка — река на востоке города Москвы, левый приток реки Москвы, третий по длине приток Москвы внутри МКАД. Длина реки — 12,4 км. Площадь водосборного бассейна — 70 км². В основном заключена в коллекторы.

Сыре́ц — речка, впадающая в Кирилловское озеро, из которого вытекает правый приток Днепра Почайна. Протекает по территории Киева.

Черногря́зка — небольшая река в Москве, правый приток Яузы, впадала в Яузу недалеко от устья Яузы. В настоящее время река заключена в коллектор, а долина засыпана на глубину до 8 метров.
Черну́шка — река, протекающая в северо-западной части Москвы, впадает в канал имени Москвы в южной части шлюза № 8. Длина по разным данным составляет от 3,8 до 6 км, значительная часть заключена в коллектор. Приток реки Химки.
Лиано́зовский ручей — ручей в районе Лианозово города Москвы, правый приток Алтуфьевской речки (Самотёки), частично сохранился в открытом русле.
Горя́чка — река в Останкинском районе Москвы, правый приток Яузы, заключён в коллектор.

Оле́ний руче́й — ручей в парке «Сокольники» города Москвы, правый приток Яузы, частично заключён в коллектор.
Богаты́рский ручей — ручей в Москве, на территории национального парка Лосиный Остров, левый приток Яузы. Протекает в основном в открытом русле.
Лео́новский ручей — малая река в районах Свиблово и Ростокино Северо-Восточного административного округа Москвы, левый приток Яузы. Длина реки составляет 2,6 км. Первый гидроним произошёл от села и усадьбы Леоново, второй — от урочища Высково. Леоновским ручьём ошибочно называли реку Будайку и слив с Капустянского пруда. По состоянию на начало 2018 года почти целиком заключён в подземный коллектор.