«Пе́рмские авиали́нии», государственное краевое унитарное предприятие — российская компания, управляющая аэропортом Большое Савино (Пермь), аэропортом Кудымкара, вертолётной площадкой в Чайковском. Ранее (1992—2009) являлась авиаперевозчиком. Штаб-квартира находится в городе Перми.

«Красноя́рские авиали́нии» (KrasAir) — российская авиакомпания, созданная в 1991 году. До ликвидации в 2009 году — четвёртая по величине авиакомпания России с аэропортом базирования Емельяново (Красноярск).
Сара́товские авиали́нии — российское авиапредприятие, занимавшееся авиаперевозками и эксплуатацией аэропорта Саратов-Центральный. По итогам 2017 года пассажиропоток авиакомпании составил 750 000 человек. Базировалась в аэропортах Саратов-Центральный и Красноярск (Емельяново). Головной офис компании находится в Саратове.

«Дальавиа» — авиакомпания Дальнего Востока России. «Дальавиа» являлась одним из крупнейших авиапредприятий Российской Федерации. Базировалась в Хабаровске. Существовала с 1953 года по 2009 год. Выполняла рейсы по СНГ и за рубеж.

Домодедовские авиалинии — российская авиакомпания, основанная в Москве и базировавшаяся в Домодедовском международном аэропорту. Выполняла рейсы по СНГ, в Китай, Сингапур, Малайзию. В 2008 году авиакомпания столкнулась со значительными финансовыми сложностями, и прекратила выполнение полетов. 3 февраля 2009 года был аннулирован сертификат эксплуатанта авиакомпании. Ожидается, что имущество «Домодедовских авиалиний» может войти в состав создаваемой авиакомпании «Росавиа».
«Самара» — бывшая российская авиакомпания, базировалась в Самаре, в международном аэропорту Курумоч. Выполняла регулярные и чартерные рейсы из Самары. Главным образом это были полёты по СНГ, но были также перевозки в Турцию, Израиль, ОАЭ, Испанию, Австрию, Таиланд и на Кипр.

Sky Express — ранее существовавшая российская авиакомпания, первая низкобюджетная авиакомпания в стране, основанная в 2006 году. Базировалась в московском аэропорту Внуково. По числу перевезённых пассажиров в 2009 году занимала 10 место в стране и 13 место по данным Федерального агентства воздушного транспорта. Прекратила деятельность осенью 2011 года, сертификат авиаперевозчика был аннулирован Росавиацией 31 октября 2011 года. 11.09.2012 г. Арбитражный суд Краснодарского края признал авиакомпанию несостоятельной (банкротом). Полное название: Закрытое акционерное общество «Небесный экспресс»; краткое — ЗАО «Скай экспресс».
Авиакомпания МОСКОВИЯ — российская авиакомпания, образованная в 1995 году на базе ФГУП «Летно-исследовательский институт им. М. М. Громова». 30 января 2008 года авиакомпания была официально переименована в ОАО «Авиакомпания МОСКОВИЯ».
АО «Авиакомпания „Якутия“ — российская авиакомпания, базируется в аэропортах «Якутск» и «Внуково» (Москва).
ОАО «Авиакомпания „Даурия“» — российская авиакомпания, базировавшаяся в Чите. Осуществляла региональные авиаперевозки в Забайкальском крае вплоть до конца 2010 года.

«А́тлас Джет» — бывшая российская авиакомпания, специализирующаяся на перевозках деловой авиации и чартерных рейсах. Базируется в аэропортах «Шереметьево» (Москва), «Толмачёво» (Новосибирск), «Новокузнецк-Спиченково» (Новокузнецк) и «Курумоч» (Самара).

I fly — российская чартерная авиакомпания, выполняющая международные рейсы для туроператоров TEZ TOUR и Tui.

Авиакомпания «РусЛайн» — российская авиакомпания, выполняющая регулярные, чартерные и перевозки деловой авиации из московского аэропорта Внуково и других городов по России, в страны СНГ и дальнего зарубежья.

«Авиали́нии Мордо́вии» — российское авиапредприятие, эксплуатант аэропорта Саранск и бывший авиаперевозчик, осуществлявший до февраля 2013 года регулярные и чартерные рейсы из Саранска.

ОАО «Авиалинии Дагестана» — закрытое в декабре 2011 года авиапредприятие, базировавшееся в Махачкалe. Авиакомпания осуществляла регулярные рейсы из Дагестана в Москву, Санкт-Петербург, периодически выполнялись полёты в Стамбул, ОАЭ и паломнические рейсы на хадж.
ООО «Авиакомпания „Башкортостан“» — бывшая российская авиакомпания, базировавшаяся в городе Уфе, Башкортостан. Специализировалась на аэрофотосъёмке. В компании работал 101 сотрудник.
ЮТэ́йр-Экспре́сс — бывшая российская региональная авиакомпания, осуществлявшая внутренние пассажирские и грузовые перевозки. Является дочерней компанией ОАО «ЮТэйр», базировавшейся в аэропорту Сыктывкара. Является также оператором аэропорта Варандей в Ненецком автономном округе.

«Авиалинии Харькова» — украинская авиакомпания, специализировавшаяся на выполнении чартерных рейсов из Харькова и Киева на курорты Турции и Египта под заказ туристического оператора Pegas Touristik. Флот компании состоял из одного Airbus A321.

17 марта 2005 года самолёт Ан-24 RA-46489 авиакомпании «Региональные авиалинии» (Кемерово) 16 марта выполнял чартерный рейс Уфы-Пермь-Усинск-Варандей. Из Уфы самолёт вылетел в 6.30 по московскому времени. Расчётное время прибытия в Варандей - 13.45. В Перми на борт самолёта была принята вахта работников «Нарьян-Марнефтегаза», 44 человека, экипаж самолёта составлял 8 человек. Первая связь с диспетчером аэропорта Варандей была осуществлена в 13 часов 15 минут. В 13.40 экипаж запросил разрешение на посадку, при этом высота полёта составляла 1500 метров. В 13.45 экипаж доложил о снижении высоты полёта до 250 метров. При этом командир сказал, что визуально наблюдает посадочную полосу, доложил о готовности к посадке и получил от диспетчера разрешение на посадку. Снижение высоты полёта произошло в 4,5 километра от посадочной полосы. В условиях «белой мглы» и отсутствия видимости ориентиров на подстилающей поверхности, экипаж принял за полосу контрастно видимый участок свежеотсыпанной дороги, расположенный в 4 км до взлётно-посадочной полосы. Высота полёта в этот момент должна была составлять не менее двухсот метров. Диспетчер визуально наблюдал нештатное снижение высоты, но предупредить экипаж не успел. Самолёт накренился на левое крыло, после чего произошло столкновение самолёта с песчаной насыпью высотой около шести метров. Самолёт разрушился и сгорел. Погибло 26 пассажиров и 2 члена экипажа.

Эйр Самара — российская авиакомпания, базировавшаяся в международном аэропорту Курумоч, Самара.