Би́тца — река на юго-западе Москвы и в Московской области, значительный левый приток Пахры, второй по длине и мощности. В верховьях Битцы находятся памятники природы: усадьба «Малое Голубино», «Старый ельник в усадьбе Знаменское-Садки», Знаменский смешанный лес и Знаменская суборь. В долине реки расположены экологические тропы, по которым проходят экскурсии. Купание в реке запрещено.
В пределах МКАД находятся около 150 малых рек и ручьёв, а также около 240 открытых водоёмов. Большинство малых рек в черте города заключены в коллекторы.
Серебря́нка — река в Восточном административном округе Москвы, левый исток Хапиловки. В прошлом считалась левым и самый крупным притоком Сосенки. По степени техногенной трансформации Серебрянка относится ко II классу — на поверхности находится около 50—90 % водотока, русло умеренно трансформировано.
Ка́менка — малая река в районе Крюково города Зеленограда, левый приток Горетовки. Речное русло на некоторых участках заключено в подземный коллектор. Название реки указывает на каменистое русло. На левом берегу находится деревня Каменки, на правом — Кукуевка. Правым притоком реки является ручей Кукуевская балка. В долине Каменки расположены многочисленные родники.
Горе́товка — река в Московской области России, правый приток Сходни.
Саморо́динка — малая река в районах Проспект Вернадского и Тропарёво-Никулино Западного административного округа, Обручевский Юго-Западного административного округа Москвы, правый приток Очаковки. Частично заключена в подземный коллектор, русло сильно трансформировано. В истоках Самородинки, у станции метро «Беляево», находилась деревня Беляево, на правом берегу возле устья — деревня Никольское. Долина Самородинки в 1991 году была объявлена памятником природы.
Чури́лиха — река на востоке города Москвы, левый приток реки Нищенки. Частично заключена в коллекторы. На реке четыре крупных пруда: Верхний Кузьминский, Нижний Кузьминский, Шибаевский, Люблинский и ряд более мелких. Притоки: Кусковский и Косинский ручьи. Длина — 13,4 км.
Фи́лька — река на западе Москвы, правый приток реки Москвы, почти на всём своём протяжении заключённая в подземный коллектор. Общая длина — около 10 км, площадь водосборного бассейна — 13 — 15 км².
Со́сенка — река в Москве, правый и основной исток (приток) Хапиловки. Длина — 8,8 километра. Сейчас основная часть русла Сосенки заключена в коллектор. Площадь бассейна около 30 км².
Бу́бна — река в центре Москвы, левый приток реки Пресни, заключена в подземный коллектор, длина — 1,4 км. Исток находился в Козьем болоте, ныне на месте которого Патриаршие пруды.
Со́сенка — река в России, протекает на новых территориях города Москвы, до 1 июля 2012 года — в Ленинском районе Московской области. Впадает в реку Десну в 24 км от её устья по левому берегу. Длина реки составляет 20 км, площадь водосборного бассейна — 107 км².
Алту́фьевская речка (Самотёка) — водоток в северной части Москвы, правый приток реки Чермянки. Длина примерно 5 км. Берёт начало из пруда рядом с селом Алтуфьево, проходит практически сразу же под Алтуфьевским шоссе и вдоль Алтуфьевского кладбища, затем вдоль северной границы Алтуфьевского лесопарка, ниже Мелиховской улицы заключена в бетонную конструкцию.
Корюшка — река на юге Москвы, в поселении Сосенское Новомосковского административного округа и районе Южное Бутово Юго-Западного административного округа, правый исток реки Цыганки. Частично протекает в открытом русле.
Рождественка — река в России, в районе Митино Москвы, правый приток Сходни. Протекает в открытом русле.
Грачёвка — река в России, в городском округе Химки Московской области и Москве, правый приток Химки. Частично протекает в открытом русле. Длина около 6 км. Нижние 1,7 км затоплены Химкинским водохранилищем, образуя Бутаковский залив. На территории Москвы 1,3 км.
Лиано́зовский ручей — ручей в районе Лианозово города Москвы, правый приток Алтуфьевской речки (Самотёки), частично сохранился в открытом русле.
Коровий Враг — ручей в Московской области и Москве, левый приток Лихоборки, частично сохранился в открытом русле.
Богаты́рский ручей — ручей в Москве, на территории национального парка Лосиный Остров, левый приток Яузы. Протекает в основном в открытом русле.
Ле́вая Ржа́вка — малая река в Зеленограде, левый приток Ржавки. Название встречается в геологических исследованиях территории Подмосковья с 1990-х годов.
Миха́йловский овраг — малая река в Москве и Московской области, левый приток Битцы. Верховья реки засыпаны, речное русло южнее МКАД трансформировано и заключено в подземный коллектор. На территории Аннинского лесопарка сохранился в открытом течении на протяжении 350 метров. Название антропонимическое.
