Российская открытая академия транспорта Российского университета транспорта — структурное подразделение Российского университета транспорта. Была основана в 1951 году как Всесоюзный заочный институт инженеров железнодорожного транспорта. В 1995 году переименован в Российский государственный открытый технический университет путей сообщения. С 2009 года — в составе МИИТа.

Ростовский государственный университет путей сообщения (РГУПС), ранее Ростовский институт инженеров железнодорожного транспорта (РИИЖТ) — российский ВУЗ в городе Ростов-на-Дону. Подведомственен Министерству транспорта РФ в лице Федерального агентства ж.д. транспорта и его Южного управления.

Уральский государственный университет путей сообщения (УрГУПС), основанный в 1956 году — российское высшее учебное заведение, образовательный комплекс, расположенный на территории 5 субъектов РФ: в Екатеринбурге, Перми, Кургане, Челябинске, Тюмени. В состав университетского комплекса входит головной вуз в Екатеринбурге, колледж железнодорожного транспорта УрГУПС, медицинский колледж УрГУПС, Пермский институт железнодорожного транспорта, Челябинский институт путей сообщения, Курганский институт железнодорожного транспорта, филиалы УрГУПС в Тюмени и в Нижнем Тагиле, представительство в Карталы.

Петербургский государственный университет путей сообщения Императора Александра I — федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования.

Иркутский государственный университет путей сообщения — высшее учебное заведение, один из ведущих учебных и научно-инженерных центров Сибири и Дальнего Востока России в сфере железнодорожного транспорта.

Александр Васильевич Ефимов — советский и российский организатор высшей школы, ректор (1990—2008) и президент Уральского государственного университета путей сообщения (2008—2016).

Сибирский государственный университет путей сообщения (СГУПС) — высшее учебное заведение в Новосибирске. ВУЗ курирует Федеральное агентство ж.д. транспорта Минтранса РФ.

Украинский государственный университет железнодорожного транспорта — расположенное в Харькове государственное высшее учебное заведение IV уровня аккредитации, подчинённое Министерству образования и науки Украины.
Андрей Павлович Хоменко — ректор Иркутского государственного университета путей сообщения.
Ива́н Миха́йлович Головны́х — бывший ректор Национального исследовательского Иркутского государственного технического университета (2000 — 19 июля 2013, доктор технических наук, профессор, действительный член РАЕН и МАН ВШ, заведующий кафедрой менеджмента менеджмента и логистики на транспорте и председатель диссертационного совета ИрГТУ. С 2009 по 2013 годы — Председатель общественной палаты Иркутской области.
Евгений Михайлович Тарасов — учёный, преподаватель, доктор технических наук (2004), профессор.

Владимир Дмитриевич Верескун — доктор технических наук, ректор Сибирского государственного университета путей сообщения (2005—2012), ректор Ростовского государственного университета путей сообщения. Заслуженный работник высшей школы Российской Федерации (2024).
Никола́й Ива́нович Данько́ — украинский учёный, ректор Украинской государственной академии железнодорожного транспорта. Доктор технических наук, профессор, академик Транспортной академии Украины, Заслуженный работник транспорта Украины.

Донецкий институт железнодорожного транспорта (ДонИЖТ) — высшее учебное заведение, которое осуществляет подготовку инженеров и экономистов для магистрального и промышленного железнодорожного транспорта, системы транспортного строительства и других отраслей экономики. Институт — единственное высшее учебное заведение в Донецком регионе, который осуществляет подготовку специалистов-железнодорожников. Был образован в качестве Донецкого филиала Харьковского института железнодорожного транспорта в 1967 году Имеет в своем составе 5 факультетов и 10 кафедр.

Юрий Анатольевич Давыдов — ректор ДВГУПС с 19 марта 2015 года по 27 декабря 2020 года, доктор технических наук, профессор.

Поздеев Владимир Николаевич (1931—2018) — российский ученый, кандидат технических наук, профессор, первый ректор Иркутского Государственного Университета Путей Сообщения (1975—1980), академик российской академии транспорта (2000), почетный работник Восточно-Сибирской железной дороги (2006).

Леонид Петрович Сурков — ректор Иркутского Государственного Университета Путей Сообщения (1987—2002), кандидат экономических наук, профессор, заведующий кафедрой «Экономика и управление на железнодорожном транспорте» (ЭиУЖТ), академик Международной академии наук педагогического образования. член-корреспондент Сибирского отделения Академии наук высшей школы.
Каргапольцев Сергей Константинович — доктор технических наук, профессор, ректор ИрГУПС, почетный работник высшего профессионального образования Российской Федерации, заслуженный работник науки и высшей школы Иркутской области, член Российской инженерной академии.
Валерий Николаевич Рыжиков — ректор Иркутского государственного аграрного университета имени А. А. Ежевского (1989—1992), кандидат химических наук, доцент.
Угрюмов Аркадий Константинович — инженер путей сообщения, специалист в области управления процессами перевозок, доктор технических наук, профессор, заслуженный деятель науки и техники РСФСР.