
Ка́менка — река в Северо-Восточном административном округе Москвы, правый приток Яузы. Частично заключена в подземный коллектор. Название Каменка характерно для рек с каменистым руслом. К югу от улицы Академика Комарова по правому берегу реки находился Кашёнкин луг, от которого Каменка получила название Кашенка. Приустьевый участок Каменки является прежним руслом Яузы.

Ка́менка — малая река в районе Крюково города Зеленограда, левый приток Горетовки. Речное русло на некоторых участках заключено в подземный коллектор. Название реки указывает на каменистое русло. На левом берегу находится деревня Каменки, на правом — Кукуевка. Правым притоком реки является ручей Кукуевская балка. В долине Каменки расположены многочисленные родники.

Жа́бенка — река в Тимирязевском районе Северного административного округа Москвы, правый приток Лихоборки. Своё название получила от слова «жаба». Речное русло частично заключено в подземный коллектор. Вода Жабенки загрязнена нефтепродуктами и солями тяжёлых металлов. Левым притоком реки является Коптевский ручей, правым — Фермерский ручей.

Конько́вский руче́й — малая река на юге Москвы, на территории района Коньково и Битцевского леса Юго-Западного административного округа Москвы, левый приток Чертановки. Частично протекает в подземном коллекторе.
Ольша́нка — ручей в районах Лианозово и Бибирево Северно-Восточного административного округа Москвы, правый приток Чермянки. Водоток практически на всём протяжении заключён в подземный коллектор. По степени техногенной трансформации река относится к III классу — в открытом течении проходит на 10—49%, русло сильно трансформировано.

Чёрный ручей — малая река в районе Ивановское Восточного административного округа города Москвы, левый приток Серебрянки. Водоток трансформирован и частично убран в подземный коллектор. Название ручья связано с характером воды — грязной, тёмной от торфа.
Ра́чка — малая река в Басманном и Таганском районах Центрального административного округа Москвы, правый приток Яузы и бывший левый приток Москвы-реки. В 1740 году во время разлива Рачка затопила церковь Троицы на Грязех. В 1750-м архитектор Дмитрий Ухтомский подготовил проект заключения реки в коллектор. В 1759 году речное русло канализировали. В XIX веке приустьевую часть коллектора перенаправили в Яузу. По степени техногенной трансформации Рачка относится к IV классу — река заключена в коллектор, поверхностный водоток утрачен.

Синичка — малая река на территории районов Соколиная Гора, Лефортово и Басманный города Москвы, левый приток Яузы. По степени техногенной трансформации относится к IV классу — речное русло с 1950 года заключено в подземный коллектор, поверхностный водоток утрачен.

Вавило́н — ручей в районе Хамовники Центрального административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. Низовья засыпаны, верховья убраны в подземный коллектор.
Напру́дная — небольшая река в Мещанском районе Центрального административного округа Москвы, левый приток Неглинной. С 1910 года протекает в подземном коллекторе. По степени техногенной трансформации относится к IV классу — поверхностный водоток утрачен, русло канализировано более чем на 90 %.
Ка́пля (Ка́пелька) — ручей в Мещанском районе Центрального административного округа Москвы, левый приток Напрудной. Водоток проходит в подземном коллекторе.
Са́ра — ручей в Таганском районе Центрального административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. По степени техногенной трансформации относится к IV классу — поверхностный водоток утрачен, река канализирована более чем на 90%. Ручей с 1912 года протекает в подземном коллекторе.
Ра́стань — ручей в районе Нагатино-Садовники Южного административного округа Москвы, правый приток Москвы-реки. Водосборный бассейн застроен, река протекает в подземном коллекторе.
Большой Носков ручей (Носко́вка) — малая река в районе Капотня Юго-Восточного административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. Его длина составляет 2 км, в открытом русле — 0,4 км. Площадь водосборного бассейна — 2 км². По состоянию на начало 2018 года заключен в подземный коллектор, верховья засыпаны. Название реки происходит от фамилии Носков.
Е́льницкий руче́й — ручей в Восточном административном округе Москвы, правый приток реки Сосенки. Своё название получил в конце XX века по бывшей Ельницкой пустоши. По состоянию на начало 2018 года нижняя часть русла заключена в подземный коллектор.
Котляко́вский ручей — малая река в районе Москворечье-Сабурово Южного административного округа Москвы, левый приток Чертановки. Название происходит от деревни Котляково. По состоянию на начало 2018 года ручей заключён в подземный коллектор, его долина засыпана, местность застроена промышленной зоной.
Лю́берка — река в Юго-Восточном административном округе Москвы и в городе Люберцы, правый приток Пехорки. В середине 1960-х годов по руслу Люберки вне территории Москвы проложили подземный коллектор, а с 2005 года река заключена в коллектор на территории города. В открытом течении сохранилась в Котельниках, где частично запружена. Вероятно, своё название получила по деревне Люберцы. Гидроним Либерица упоминается в документах с 1624 года, на картах XVII века известен как Либерка.
Я́сный овра́г — малая река в районе Хамовники Центрального административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. Речное русло заключено в подземный коллектор. Происхождение названия не установлено.

Ю́жный Октя́брьский руче́й — малая река в районе Хорошёво-Мнёвники Северо-Западного административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки.
Хохло́вка — малая река в Нижегородском районе Юго-Восточного административного округа Москвы, правый приток Нищенки. Своё название получила от деревни Хохловки и исторической местности Калитники. По состоянию на начало 2018 года речное русло убрано в подземный коллектор.