Се́тунька — малая река на западе Москвы, значительный правый приток Сетуни, является вторым водотоком по длине и мощности в Солнцеве.
Ка́менка — река в Северо-Восточном административном округе Москвы, правый приток Яузы. Частично заключена в подземный коллектор. Название Каменка характерно для рек с каменистым руслом. К югу от улицы Академика Комарова по правому берегу реки находился Кашёнкин луг, от которого Каменка получила название Кашенка. Приустьевый участок Каменки является прежним руслом Яузы.
Конько́вский руче́й — малая река на юге Москвы, на территории района Коньково и Битцевского леса Юго-Западного административного округа Москвы, левый приток Чертановки. Частично протекает в подземном коллекторе.
Ольша́нка — ручей в районах Лианозово и Бибирево Северно-Восточного административного округа Москвы, правый приток Чермянки. Водоток практически на всём протяжении заключён в подземный коллектор. По степени техногенной трансформации река относится к III классу — в открытом течении проходит на 10—49%, русло сильно трансформировано.
Жу́жа — река в районах Нагатино-Садовники и Нагатинский Затон Южного административного округа Москвы, правый приток Москвы-реки. Речное русло канализировано более чем на 90 %. Правым притоком реки является ручей Савкин овраг.
Ра́чка — малая река в Басманном и Таганском районах Центрального административного округа Москвы, правый приток Яузы и бывший левый приток Москвы-реки. В 1740 году во время разлива Рачка затопила церковь Троицы на Грязех. В 1750-м архитектор Дмитрий Ухтомский подготовил проект заключения реки в коллектор. В 1759 году речное русло канализировали. В XIX веке приустьевую часть коллектора перенаправили в Яузу. По степени техногенной трансформации Рачка относится к IV классу — река заключена в коллектор, поверхностный водоток утрачен.
Синичка — малая река на территории районов Соколиная Гора, Лефортово и Басманный города Москвы, левый приток Яузы. По степени техногенной трансформации относится к IV классу — речное русло с 1950 года заключено в подземный коллектор, поверхностный водоток утрачен.
Золото́й Рожо́к — малая река в районе Лефортово Юго-Восточного административного округа города Москвы, левый приток Яузы. С 1935 года протекает в подземном коллекторе. На правом берегу ручья расположена усадьба Строгановых. От гидронима ручья произошли названия: Золоторожская набережная, Золоторожская улица, Золоторожский Вал, Верхний Золоторожский переулок, Средний Золоторожский переулок и Золоторожский проезд.
Ка́пля (Ка́пелька) — ручей в Мещанском районе Центрального административного округа Москвы, левый приток Напрудной. Водоток проходит в подземном коллекторе.
Са́ра — ручей в Таганском районе Центрального административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. По степени техногенной трансформации относится к IV классу — поверхностный водоток утрачен, река канализирована более чем на 90%. Ручей с 1912 года протекает в подземном коллекторе.
Владыкинский ручей — нижний левый приток реки Лихоборки. Длина составляет от 2,5 до 3,9 км. Брал начало рядом с перекрёстком улиц 800-летия Москвы и Дубнинской. Долина просматривается к западу от Керамического проезда, вдоль Поморской улицы и к востоку от Алтуфьевского шоссе. Сохранились железнодорожные мосты через ручей на Савёловском направлении между станциями Дегунино и Бескудниково, а также на разобранном ответвлении к Алтуфьевской овощной базе. Участок русла под мостом заболочен, коллектор, по всей видимости, засорен. Ручей пересекал современную улицу Хачатуряна и впадал в реку ниже села Старое Владыкино. Ручей заключён в подземную бетонную конструкцию.
Крыла́тский руче́й — водоток в районе Крылатское Западного административного округа Москвы, правый приток Москвы-реки на территории ландшафтного заказника «Крылатские холмы». По степени техногенной трансформации относится к III классу — в открытом течении проходит на 10—49 %, речное русло сильно трансформировано. Река протекает в овраге Каменная Клетва, который является самой длинной и крупной по площади овражно-балочной системой «Крылатских холмов».
Со́болевский руче́й — небольшая река в районе Щукино Северо-Западного административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. Протекает в подземном коллекторе, по степени техногенной трансформации относится к IV классу — поверхностный водоток утрачен, русло канализировано более чем на 90 %.
Руче́й Ва́тной фа́брики — небольшая река в районах Измайлово и Северное Измайлово Восточного административного округа Москвы, правый приток Серебрянки. По степени техногенной трансформации относится к IV классу — поверхностный водоток утрачен, река канализирована более чем на 90 %. На берегах реки располагались село Измайлово и слободы Калгановская, Попова, Хохловская и Штатная.
Богоя́вленский руче́й — малая река в районе Марфино Северо-восточного административного округа Москвы, нижний правый приток реки Лихоборки. Заключён в подземный коллектор диаметром 1,5 метра.
Дани́ловский ручей (Дани́ловка, Худе́ница) — малая река Южного административного округа Москвы в бывшей Даниловской слободе, правый приток Москвы-реки. Своё название получил от Данилова монастыря, вдоль которого проходил водоток. Гидроним «Худеница» возник по урочищу, которое располагалось на этой территории. По состоянию на начало 2018 года заключён в подземный коллектор.
Кобы́лий овраг — бывшая малая река в районе Дорогомилово Западного административного округа Москвы, правый приток Москвы-реки. Название происходит от слова «кобыла».
Лени́вка — бывшая малая река в районе Хамовники Центрального административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. Получил название благодаря своему медленному, спокойному течению. На берегу ручья располагался Ленивый Торжок, то есть рынок. Гидроним Волхонка, возник от одноимённой улицы.
По состоянию на начало 2018 года заключена в подземный коллектор или полностью засыпана.
Ю́жный Октя́брьский руче́й — малая река в районе Хорошёво-Мнёвники Северо-Западного административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки.
Хохло́вка — малая река в Нижегородском районе Юго-Восточного административного округа Москвы, правый приток Нищенки. Своё название получила от деревни Хохловки и исторической местности Калитники. По состоянию на начало 2018 года речное русло убрано в подземный коллектор.
— исток, 
— устье
