| № | Наименование музея | Местонахождение | Изображение | Примечания |
|---|
| 1 | Азовский историко-археологический и палеонтологический музей-заповедник | город Азов |  | |
| 2 | Аксайский военно-исторический музей | город Аксай |  | |
| 3 | Археологический музей-заповедник «Танаис» | хутор Недвиговка,
Мясниковский район |  | |
| 4 | Батайский музей истории | город Батайск | | |
| 5 | Белокалитвинский историко-краеведческий музей | город Белая Калитва |  | |
| 6 | Боковский районный краеведческий музей | станица Боковская,
Боковский район | | |
| 7 | Военно-исторический комплекс имени Н. Д. Гулаева | город Аксай | | Находится на территории природоохранного заповедника областного значения «Мухина балка». |
| 8 | Волгодонский художественный музей | город Волгодонск | | |
| 9 | Волгодонский эколого-исторический музей | город Волгодонск | | |
| 10 | Государственный музей-заповедник М. А. Шолохова | станица Вёшенская, Шолоховский район | | |
| 11 | Гуковский музей шахтёрского труда имени Л.И. Микулина | город Гуково | | |
| 12 | Дом-музей С. М. Будённого | станица Будённовская,
Пролетарский район | | |
| 13 | Дом-музей М. Б. Грекова | город Новочеркасск |  | |
| 14 | Дом-музей В. А. Закруткина | станица Кочетовская,
Семикаракорский район | | Является структурным подразделением Семикаракорского историко-краеведческого музея. |
| 15 | Дом-музей И. И. Крылова | город Новочеркасск |  | |
| 16 | Донецкий историко-краеведческий музей | город Донецк |  | |
| 17 | Донской военно-исторический музей | город Ростов-на-Дону и хутор Недвиговка | | |
| 18 | Донской музей МЧС[1] | город Ростов-на-Дону | | Адрес: переулок Доломановский, 132Б. |
| 19 | Естественнонаучный музей Южного федерального университета[2] | город Ростов-на-Дону | | Находится на химическом факультете ЮФУ. |
| 20 | Жуковский районный музей краеведения | станица Жуковская,
Дубовский район | | |
| 21 | Историко-краеведческий музей Песчанокопского района | село Песчанокопское,
Песчанокопский район | | |
| 22 | Историко-краеведческий музей (Таганрог) | город Таганрог |  | Филиал Таганрогского государственного литературного и историко-архитектурного музея-заповедника. |
| 23 | Каменский музей декоративно-прикладного искусства и народного творчества | город Каменск-Шахтинский |  | |
| 24 | Кашарский музей истории и краеведения | слобода Кашары,
Кашарский район | | |
| 25 | Краеведческий музей Октябрьского района Ростовской области | посёлок Каменоломни,
Октябрьский район | | |
| 26 | Краеведческий музей школы № 1 (Донецк)[3] | город Донецк |  | |
| 27 | Литературный музей А. П. Чехова | город Таганрог |  | Бывшая Таганрогская мужская гимназия. Входит в состав Таганрогского государственного литературного и историко-архитектурного музея-заповедника. |
| 28 | Мартыновский районный краеведческий музей имени Карпенко | слобода Большая Мартыновка,
Мартыновский район | | |
| 29 | Матвеево-Курганский краеведческий музей | посёлок Матвеев Курган,
Матвеево-Курганский район | | |
| 30 | Миллеровский краеведческий музей | город Миллерово | | |
| 31 | Морозовский краеведческий музей | город Морозовск | | |
| 32 | Музей 13 Героев Советского Союза | хутор Красновка,
Тарасовский район | | |
| 33 | Музей И. Д. Василенко | город Таганрог |  | Входит в состав Таганрогского государственного литературного и историко-архитектурного музея-заповедника. |
| 34 | Музей А. А. Дурова | город Таганрог |  | Входит в состав Таганрогского государственного литературного и историко-архитектурного музея-заповедника. |
| 35 | Музей истории виноградарства и виноделия | город Новочеркасск |  | Создан при Всероссийском научно-исследовательском институте виноградарства и виноделия. |
| 36 | Музей градостроительства и быта | город Таганрог |  | Входит в состав Таганрогского государственного литературного и историко-архитектурного музея-заповедника. |
| 37 | Музей истории развития связи на Дону | город Ростов-на-Дону | | |
| 38 | Музей истории Шахтинской милиции | город Шахты | | |
| 39 | Музей краеведения Волгодонского района | станица Романовская,
Волгодонской район | | |
| 40 | Музей «Легенды СССР» | город Каменск-Шахтинский |  | Частный музей с одноимённым отелем на автомобильной трассе М-4 Дон. |
| 41 | Музей русско-армянской дружбы | город Ростов-на-Дону |  | |
| 42 | Музей Северо-Кавказской железной дороги | город Ростов-на-Дону |  | Расположен на железнодорожной станции Гниловская. |
| 43 | Музей села Крым | село Крым,
Мясниковский район | | |
| 44 | Музей современного изобразительного искусства | город Ростов-на-Дону |  | |
| 45 | Музей Фаины Раневской | город Таганрог |  | |
| 46 | Народный военно-исторический музейный комплекс Великой Отечественной войны «Самбекские высоты» | село Самбек, Неклиновский район |  | Самый крупный в регионе. Включает в себя: Мемориал славы «Героям прорыва Миус-фронта и освобождения города Таганрога», Донской военно-исторический музей, ИВЦ, Интерактивную площадку «Прорыв», Аллею памяти, воинское захоронение, Сад Победы, парк «Самбек». Входит в состав Таганрогского государственного литературного и историко-архитектурного музея-заповедника. |
| 47 | Новочеркасский музей истории Донского казачества | город Новочеркасск |  | |
| 48 | Новошахтинский историко-краеведческий музей | город Новошахтинск | | |
| 49 | Обливский краеведческий музей | станица Обливская,
Обливский район | | |
| 50 | Раздорский этнографический музей-заповедник | станица Раздорская,
Усть-Донецкий район | | |
| 51 | Ростовский областной музей изобразительных искусств | город Ростов-на-Дону |  | |
| 52 | Ростовский областной музей краеведения | город Ростов-на-Дону |  | |
| 53 | Ростовский музей космонавтики | город Ростов-на-Дону |  | |
| 54 | Сальский музей имени народного художника В. К. Нечитайло | город Сальск |  | |
| 55 | Семикаракорский историко-краеведческий музей | город Семикаракорск | | |
| 56 | Старочеркасский историко-архитектурный музей-заповедник | станица Старочеркасская,
Аксайский район |  | |
| 57 | Таганрогский военно-исторический музей | город Таганрог |  | |
| 58 | Таганрогский государственный литературный и историко-архитектурный музей-заповедник | город Таганрог | | |
| 59 | Таганрогский музей авиационной техники | город Таганрог |  | |
| 60 | Таганрогский политехнический музей | город Таганрог | | Расположен на территории ТТИ ЮФУ. |
| 61 | Таганрогский художественный музей | город Таганрог |  | |
| 62 | Тацинский историко-краеведческий музей | станица Тацинская,
Тацинский район | | |
| 63 | Цимлянский районный краеведческий музей | город Цимлянск,
Цимлянский район | | |
| 64 | Шахтинский краеведческий музей | город Шахты | | Здание музея является памятником архитектуры конца XIX века. |
