Ка́менка — река в Северо-Восточном административном округе Москвы, правый приток Яузы. Частично заключена в подземный коллектор. Название Каменка характерно для рек с каменистым руслом. К югу от улицы Академика Комарова по правому берегу реки находился Кашёнкин луг, от которого Каменка получила название Кашенка. Приустьевый участок Каменки является прежним руслом Яузы.
Городня́ — река на юге Москвы, второй по длине и расходу воды правый приток Москвы-реки в черте города. Образует Царицынские, Борисовские и ряд более мелких прудов.
Конько́вский руче́й — малая река на юге Москвы, на территории района Коньково и Битцевского леса Юго-Западного административного округа Москвы, левый приток Чертановки. Частично протекает в подземном коллекторе.
Ра́чка — малая река в Басманном и Таганском районах Центрального административного округа Москвы, правый приток Яузы и бывший левый приток Москвы-реки. В 1740 году во время разлива Рачка затопила церковь Троицы на Грязех. В 1750-м архитектор Дмитрий Ухтомский подготовил проект заключения реки в коллектор. В 1759 году речное русло канализировали. В XIX веке приустьевую часть коллектора перенаправили в Яузу. По степени техногенной трансформации Рачка относится к IV классу — река заключена в коллектор, поверхностный водоток утрачен.
Золото́й Рожо́к — малая река в районе Лефортово Юго-Восточного административного округа города Москвы, левый приток Яузы. С 1935 года протекает в подземном коллекторе. На правом берегу ручья расположена усадьба Строгановых. От гидронима ручья произошли названия: Золоторожская набережная, Золоторожская улица, Золоторожский Вал, Верхний Золоторожский переулок, Средний Золоторожский переулок и Золоторожский проезд.
Кровя́нка — водоток в Гагаринском и Донском районах Юго-Западного административного округа Москвы, левый приток Чуры. Речное русло в 1955—1961 годах было частично заключено в подземный коллектор.
Шмелёвка — малая река в Южном административном округе Москвы, правый приток Городни. Частично заключена в подземный коллектор, по степени техногенной трансформации относится ко II классу — на поверхности находится около 50—90 % водотока, русло умеренно трансформировано. Долина реки в 1991 году была объявлена памятником природы.
Со́болевский руче́й — небольшая река в районе Щукино Северо-Западного административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. Протекает в подземном коллекторе, по степени техногенной трансформации относится к IV классу — поверхностный водоток утрачен, русло канализировано более чем на 90 %.
Спирков вра́жек — небольшая река в Северном административном округе Москвы, левый приток Лихоборки. Протекает по территории Западного Дегунино, Дмитровского и Головинского районов. По степени техногенной трансформации относится к IV классу — речное русло заключено в подземный коллектор, поверхностный водоток утрачен.
Беля́евский овраг — малая река на юге Москвы, в районе Царицыно Южного административного округа, левый приток Пушкина оврага (Котляковки). Верховья полностью засыпаны.
Бояко́в овра́г (Буяков овраг) — ручей в Южном административном округе Москвы, правый приток реки Городни. Своё название получил от фамилии Буяков.
Зениборовский овраг — ручей в районах Чертаново Южное и Северное Бутово Юго-Западного административного округа Москвы, левый приток Битцы у Верхнего Качаловского пруда. Большая часть реки убрана в коллектор, долина полностью засыпана. В открытом русле ручей сохранился только на территории Битцевского леса. Точное происхождение названия не установлено. Гидроним, вероятно, имеет антропонимическое происхождение. На старых картах овраг подписан неразборчиво, возможно его называли Зепиборовским.
Кобы́лий овраг — бывшая малая река в районе Дорогомилово Западного административного округа Москвы, правый приток Москвы-реки. Название происходит от слова «кобыла».
Лео́новский ручей — малая река в районах Свиблово и Ростокино Северо-Восточного административного округа Москвы, левый приток Яузы. Длина реки составляет 2,6 км. Первый гидроним произошёл от села и усадьбы Леоново, второй — от урочища Высково. Леоновским ручьём ошибочно называли реку Будайку и слив с Капустянского пруда. По состоянию на начало 2018 года почти целиком заключён в подземный коллектор.
Миха́йловский овраг — малая река в Москве и Московской области, левый приток Битцы. Верховья реки засыпаны, речное русло южнее МКАД трансформировано и заключено в подземный коллектор. На территории Аннинского лесопарка сохранился в открытом течении на протяжении 350 метров. Название антропонимическое.
Песо́чный ручей (Прото́к) — ручей в районе Арбат Центрального административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. «Песочным» водоток назвали по характеру почвы, а «протоком» обычно наименовали сухие речные русла. С конца XIX века ручей заключён в подземный коллектор, а его долина полностью засыпана.
Петря́ев овраг — малая река в Москве и Московской области, левый приток Битцы. На территории города заключена в подземный коллектор. Своё название получила от фамилии Петряев или от личного имени Петряй.
Руза́ев овраг — малая река в районе Ясенево Юго-Западного административного округа Москвы, левый приток Битцы. Частично заключена в подземный коллектор, речное русло трансформировано, местами засыпано и застроено. В 2017 году постановлением Правительства Москвы от 5 декабря 2017 года № 961-ПП Рузаев овраг с прудом, общей площадью 0,88 га, включили в состав природного комплекса ЮЗАО Москвы. Название антропонимическое.
Плинто́вка — малая река в районе Капотня Юго-Восточного административного округа Москвы, левый приток Москвы-реки. Своё название получила от географического термина «плинтовка», который означает «участок пахотной земли на болоте». Речное русло заключено в подземный коллектор. По сообщению диггеров, вода Плинтовки сильно загрязнена нефтепродуктами. Питание реки осуществляется за счёт её притоков — Лесного и Среднего ручьёв.
Сенько́вский овраг — малая река в районах Чертаново Южное и Чертаново Центральное Южного административного округа Москвы, правый приток Городни. Речное русло заключено в подземный коллектор. Название антропонимическое.
