Индика́тор — соединение, позволяющее визуализировать изменение концентрации какого-либо вещества или компонента, например, в растворе при титровании, или быстро определить pH, еН и другие параметры.

Флуоресцеин (диоксифлуоран) — органическое соединение с химической формулой C20H12O5, относящееся к группе ксантеновых красителей, входящей в класс трифенилметановых красителей. Имеет вид оранжево-красных кристаллов, плохо растворимых в воде, с образованием раствора, флуоресцирующего зелёным цветом. Применяется для получения других ксантеновых красителей, а также как адсорбционный и кислотно-основный индикатор.

Гематоксилин — органическое соединение, природный краситель, получаемый из эфирного экстракта кампешевого дерева. Применяется в виде различных растворов для окрашивания гистологических препаратов. При окраске гематоксилином клеточные ядра приобретают тёмно-синий цвет.

Эозин Н (динатриевая соль 2,4,5,7-тетрабромфлуоресцеина) — органическое соединение, ксантеновый флуоресцентный краситель, одна из форм эозина с химической формулой C20H6Br4O5Na2. Образуется при бромировании флуоресцеина. Буква Н в названии означает динатриевую соль, аналогичная дикалиевая соль носит название «Эозин К». Красновато-коричневый порошок, хорошо растворимый в воде.

Химические цветовые реакции — изменение цвета различных макро- и микроскопических структур грибов под действием некоторых химических реактивов. Химический метод исследования используется при идентификации образцов грибов для различения таксономических групп. Таксономическим признаком может служить как положительный или отрицательный результат исследования, так и вариации в изменении окраски при положительных реакциях, поскольку один и тот же реактив может давать разное окрашивание у разных видов грибов.

Реактив Шиффа — реактив для качественного определения альдегидной группы органических соединений, открытый Хуго Шиффом.

Нейтральный красный (3-амино-6-диметиламино-2-метилфеназоний хлористый) — органическое соединение с химической формулой C15H17ClN4, производное феназина, относящееся к диазиновым красителям. Используется в микробиологии для прижизненного окрашивания клеточных культур и в аналитической химии как кислотно-основной индикатор.

Сафрани́н (3,6-диамино-2,7-диметил-10-фенилфеназинхлоргидрат) — органическое соединение, основный диазиновый краситель, относящийся к классу сафранинов, с химической формулой C20H19N4Cl. Тёмно-красный порошок, растворимый в воде и спирте. Применяется как краситель для шерсти, шёлка, бумаги и кожи, несмотря на то, что имеет плохую светопрочность. Также используется для приготовления лаков, чернил, как десенсибилизатор в фотографии.

Я́нус зелёный (2-диэтиламино-3,6-диметил-9-фенилфеназоний-7-азо-4′-диметиланилин хлористый) — органическое соединение, краситель, относящийся к диазотированным сафранинам и имеющий химическую формулу C32H35N6Cl. Тёмно-зелёный порошок, дающий синий водный раствор. Применяется в микроскопии для прижизненного окрашивания, в аналитической химии — как реактив на олово и как окислительно-восстановительный индикатор.

Феносафранин (3,6-диамино-10-фенилфеназоний хлорид) — органическое соединение, основный диазиновый краситель, относящийся к классу сафранинов, с химической формулой C18H15N4Cl. Зелёные кристаллы, растворяющиеся в воде с образованием красного раствора. Применяется в микроскопии как краситель, в аналитической химии, как индикатор и в фотографии, как десенсибилизатор.

Голубой Эванса (3,3′-диметилбифенилен-4,4′-бис(7-азо-1-амино-8-гидроксинафталин-2,4-дисульфокислоты) тетранатриевая соль) — органическое соединение, прямой дисазокраситель с химической формулой C34H24N6Na4O14S4. Имеет вид мелких фиолетово-коричневых кристаллов. Применяется в микроскопии для окрашивания гистологических препаратов.

Галлоцианин (7-(диметиламино)-4-гидрокси-3-оксофеноксазин-1-карбоновая кислота) — органическое соединение, основный оксазиновый краситель с химической формулой C15H12N2O5. Применяется в микроскопии и аналитической химии.

Кристалли́ческий фиоле́товый (N,N,N′,N′,N′′,N′′-гексаметилпарарозанилин хлорид) — органическое соединение, основный трифенилметановый краситель с химической формулой C25H30N3Cl, одна из форм метилового фиолетового. Имеет вид блестящих зелёных кристаллов, применяется в качестве кислотно-основного индикатора и для различных окрасок препаратов в биологии.

4-Диметиламинобензальдегид (p-диметиламинобензальдегид, DMAB, п-ДАБА) — ароматическое органическое соединение с химической формулой (CH3)2NC6H4CHO. Имеет вид белых кристаллов, является основным компонентом реактива Эрлиха, который включает в себя, помимо диметиламинобензальдегида, ещё спирт и соляную кислоту. Применяется в микроскопии и аналитической химии, а также в органическом синтезе для получения красителей.

Трифенилмета́новые краси́тели — органические соединения, производные трифенилметана, применяющиеся в качестве красителей. Относятся к более широкой группе арилметановых красителей, в которую, помимо трифенилметановых, входят также дифенилметановые красители. Трифенилметановые красители — одни из первых синтетических красителей, первый представитель класса — фуксин, был описан в 1856 году Якубом Натансоном, а первый промышленный синтез для этого же красителя был разработан в 1859 году.

Метаниловый жёлтый (дифениламин-5-азо-1-бензол-3-сульфокислоты натриевая соль) — органическое соединение, азокраситель с химической формулой C18H14N3NaO3S, относящийся к группе тропеолинов, применяется в микроскопии и как кислотно-основный индикатор. Имеет вид жёлтого порошка, растворимого в воде и спирте.
Далия фиолетовый — трифенилметановый краситель, представляющий собой смесь двух органических соединений — кристаллического фиолетового и основного фуксина, также являющимися производными трифенилметана. Зелёный порошок, дающий фиолетовое окрашивание в растворе, применяется в биологии для окрашивания препаратов.

Окрашивание — гистологический метод, используемый для усиления контраста в микроскопических препаратах. Методы окрашивания используются в гистологии, цитологии, а также в таких областях медицины, как гистопатология, гематология и цитопатология.

Акридиновый оранжевый (3,6-бис(диметиламино)акридин) — органическое соединение, основный акридиновый краситель с химической формулой C17H19N3. Оранжевый или красный порошок, легко растворимый в воде и спирте. Применяется в микроскопии для окраски препаратов.

Метиленовый зелёный (6-нитро-3,7-бис(диметиламино)фентиазоний хлористый) — органическое соединение, основный тиазиновый краситель с химической формулой C16H17ClN4O2S. Кристаллы коричневого цвета, дающие сине-зелёный водный раствор. Применяется в микроскопии.