Ягорба — река в Череповецком районе Вологодской области России, впадает в Шекснинский русловый участок Рыбинского водохранилища в Череповце. В результате наполнения водохранилища длина реки сократилась до 53 км, а площадь водосборного бассейна до 458 км².
Барка — река в России, протекает по Щетинскому сельском поселении Череповецкого района Вологодской и Пошехонском району Ярославской области. Длина реки составляет 14 км.
Бодье — река в России, протекает по Череповецкому району Вологодской области. Исток находится в лесной болотистой местности между деревнями Поповское, Красново, Новинка и Думново. Населённых пунктов на реке нет. Устье реки находится в 9,8 км по левому берегу реки Сарка. Длина реки составляет 12 км.
Воля — река в России, протекает по Рыбинскому району Ярославской области. Исток реки находится к югу от деревни Кузнецово, река течёт на север, а после деревни Кузнецово поворачивает на северо-запад, протеккает через Большое Погорелово, вблизи Милюшино и около деревни Костино впадает в водохранилище. Устье реки находится по левому берегу Рыбинского водохранилища, ниже (южнее) устья реки Ухра и выше (севернее) устья ручья Татьянка. Длина реки составляет 12 км.
Ега — река в России, протекает по Пошехонскому району Ярославской области. Длина реки составляет 17 км. Площадь водосборного бассейна — 55,4 км².
Изоха — река в России, протекает по Брейтовскому району Ярославской области. Длина реки — 11 км.
Имая — река в России, протекает по территории Шекснинского района Вологодской области. Устье реки находится в 3 км от устья по правому берегу реки Угла между деревнями Нижний Дор и Мальгино. Длина реки составляет 13 км.
Людинка — река в России, протекает в Первомайском районе Ярославской области. Устье реки находится в 39 км по правому берегу реки Ухтома. Длина реки составляет 15 км.
Морма — река в России, левый приток Ухры, протекает по Рыбинскому району Ярославской области. Длина реки составляет 11 км.
Носа — река в России, протекает по Первомайскому и Пошехонскому районам Ярославской области. Исток находится западнее деревни Вязовка. Течёт на северо-запад мимо Оносово, Больших Балуек, Малых Балуек, Желонки, Соколово, Владычного, Большой Ширяйки, Ануфриева, Медведки. Устье реки находится в 47 км по левому берегу реки Согожа, выше по течению села Телешево. Длина реки составляет 38 км, площадь водосборного бассейна — 153 км². Имеет правые притоки Ястребка и Чёрная речка.
Нотелга — река в России, протекает по Вологодскому району Вологодской области и по границе с Ярославской областью. Исток реки образуется слиянием у нежилой деревни Павлово ручьёв Чёрного и Котел в. Река течёт на юго-восток по лесной ненаселённой местности. В 7,8 км от устья, по левому берегу реки впадает река Янгосорка. Ниже устья Янгосорки граница областей проходит по реке — правый берег Ярославская, левый — Вологодская область. Устье реки находится в 12 км по правому берегу реки Сегжи, у деревни Леушкино, расположенной на левом, вологодском берегу.
Охотка — река в России, протекает в Шекснинском районе Вологодской области. Устье реки находится в 26 км по правому берегу реки Угла. Длина реки составляет 14 км.
Пишковка — река в России, протекает по Вологодской области, к северо-востоку от деревни Пача. Правый приток Шексны. Исток реки находится южнее деревни Демидово. Русло реки почти на всем протяжении спрямлено осушительными каналами. Устье реки находится по правому берегу водохранилища Рыбинское на Шекснинском русловом участке. Длина реки составляет 15 км.
Роица — река в России, протекает в Шекснинском районах Вологодской области. Устье реки находится в 12 км по правому берегу реки Угла. Длина реки составляет 25 км.
Талица или Тоица — река в России, протекает в Арефинском сельском поселении Рыбинского района Ярославской области. Левый приток реки Ухра.
Тулша — река в России, протекает в Вологодской и Ярославской областях. Исток находится в Череповецком районе Вологодской области около деревни Гурлево. Протекает между деревнями Суковатка и Избная, после чего попадает на территорию Ярославской области. Течёт в ненаселённой лесной местности, принимает левые притоки Великий и Кубря. Далее протекает мимо деревень Мерлево, Овсянниково, Щипцово.
Чимсора — река в России, протекает по территории Ягницкого сельского поселения Череповецкого района Вологодской области, большей частью по территории Дарвинского заповедника. Длина реки составляет 21 км.
Шипинка — река в России, протекает по Брейтовскому району Ярославской области. Длина реки — 21 км, площадь водосборного бассейна — 76 км².
Инопаш — ручей в России, левый (последний) приток Шексны, протекает в Рыбинском районе Ярославской области. Длина водотока 22 км, площадь водосбора 61,8 км².
Лапка — река в России, протекает в Пошехонском районе Ярославской области, правый приток реки Ухра. Устье реки находится на 44 км по правому берегу реки Ухра. Длина реки составляет 10 км.
— исток, 
— устье
