
Эукарио́ты, или я́дерные, — домен (надцарство) живых организмов, клетки которых содержат ядро. Эукариотами, в частности, являются животные, грибы и растения. Организмы, в клетках которых ядра нет, называются прокариотами. Вирусы, вироиды и пр. не относятся ни к прокариотам, ни к эукариотам; более того, даже вопрос, считать ли их живыми организмами, является дискуссионным.

Грибы́ — царство живой природы, объединяющее эукариотические организмы, сочетающие в себе некоторые признаки как растений, так и животных. Грибы изучает наука микология, которая считается разделом ботаники, поскольку ранее грибы относили к царству растений.

Проти́сты — парафилетическая группа, к которой относят все эукариотические организмы, не входящие в состав животных, грибов и растений. Название введено Эрнстом Геккелем в 1866 году, однако в современном понимании его впервые использовал в 1969 году Роберт Уиттекер, автор «системы пяти царств». Традиционно протистов подразделяют на простейших (Protozoa), водоросли (Algae) и грибоподобные организмы; все эти группы имеют полифилетическую природу и не используются в качестве таксонов.

Во́доросли — гетерогенная экологическая группа преимущественно фотоавтотрофных одноклеточных, колониальных или многоклеточных организмов, обитающих, как правило, в водной среде, в систематическом отношении представляющая собой совокупность многих отделов. Вступая в симбиоз с грибами, водоросли в ходе эволюции образовали совершенно новые организмы — лишайники. Наука о водорослях называется альгологией, её изучение является одним из самых важных этапов при подготовке специалистов в области марикультуры, рыбоводства и морской экологии.

Талло́м, или слоеви́ще , — ботанический термин, применяемый для обозначения одноклеточного, многоклеточного или не дифференцированного на клетки (многоядерного) тела водорослей, грибов, лишайников, а также антоцеротовых и некоторых печёночных мхов.

Базидиомице́ты, или базидиа́льные грибы́, или базидиомико́та — отдел из царства грибов, включающий виды, производящие споры в булавовидных структурах, именуемых базидиями. Вместе с аскомицетами составляют подцарство высших грибов (Dikarya).

Ги́фа — нитевидное образование у грибов, состоящее из многих клеток или содержащее множество ядер. Основная функция гиф — поглощение воды и питательных веществ. Некоторые гифы специализируются и преобразуются в гаустории, ловчие петли и др. Имеются также у оомицетов и актинобактерий.

Оомицеты — клада мицелиальных организмов, включающая 70 родов и 570 видов, крупнейшая и наиболее сложная клада среди страменопил. Ранее относилась к фикомицетам (грибам), позже была переведена из царства грибов в протисты. Обитают преимущественно в водной среде, где вызывают раневые инфекции рыб или являются сапротрофами. Другие являются паразитами высших растений, в частности, к оомицетам относится Phytophthora infestans, вызывающая фитофтороз картофеля, ставший одной из причин катастрофического «картофельного голода» в Ирландии 1845—1849.

Аскомице́ты, или су́мчатые грибы́ — отдел в царстве грибов, объединяющий организмы с септированным мицелием и специфическими органами полового спороношения — сумками (асками), содержащими чаще всего по 8 аскоспор. Имеют и бесполое спороношение, причём во многих случаях половой процесс утрачивается.

Зигомико́та — отдел грибов, объединяющий 10 порядков, 27 семейств, около 170 родов и более 1000 видов. Отличаются развитым ценоцитным мицелием непостоянной толщины, в котором септы образуются только для отделения репродуктивных органов.

Бази́дия — специализированная структура полового спороношения грибов-базидиомицетов. Базидии представляют собой утолщённые терминальные (концевые) клетки дикариотических гиф или многоклеточные структуры. У экзобазидиальных грибов, не образующих плодовых тел, они формируются в гимении плодовых тел или непосредственно на мицелии; у головнёвых и ржавчинных грибов базидии возникают из крупных бесполых спор, называемых телиоспорами, телейтоспорами или пробазидиями.
В списке даны определения терминов, используемых в микологии.

Гломеромице́ты — класс грибов, выделяемый в монотипный подотдел Glomeromycotina в составе отдела Mucoromycota, содержит около 230 видов; ранее его представителей рассматривали в составе отдела зигомицетов. Древнейшие ископаемые остатки, достоверно принадлежащие гломеромицетам, имеют возраст 460 млн лет.
Гифохи́триевые — порядок грибоподобных организмов, входящий в монотипный класс Гифохитриомицеты. Хотя класс Гифохитриомицеты предлагалось выделить в монотипный отдел Гифохитриомикота, данные филогенетики свидетельствуют о родстве этих организмов с оомицетами (Oomycetes), вместе с которыми они могут быть классифицированы в составе клады Pseudofungi, рассматриваемой в качестве отдела или подотдела.

Тафриномико́товые, или тафриномице́ты — подотдел грибов отдела Аскомикота (Ascomycota). По некоторым признакам Taphrinomycotina проявляют сходство с базидиомицетами и считаются одной из наиболее древних групп аскомицетов.

Тафри́на — род грибов-аскомицетов, относящийся к монотипному семейству Тафри́новые. Все представители рода — паразиты высших растений, вызывающие различные повреждения листьев, побегов и плодов. Заболевания, вызываемые этими грибами, могут наносить урон сельскохозяйственным растениям — в частности, плодовым деревьям, а также лесным и другим насаждениям.

Phytomyxea (лат.) — класс протистов из группы ризарий, все представители — облигатные внутриклеточные паразиты. В качестве хозяев разных видов выступают высшие растения, бурые и диатомовые водоросли, а также оомицеты. Насчитывают около 40 видов, подразделяемых на два отряда — Plasmodiophorida и Phagomyxida. Ранее в Phytomyxea также включали род Haptoglossa, представители которого паразитируют на почвенных нематодах и коловратках, однако позднее была доказана их принадлежность к оомицетам.

Протомициевые, или протомицетовые — семейство грибов-аскомицетов порядка тафриновых. Все представители — паразиты цветковых растений из семейств зонтичные (Apiaceae) и астровые (Asteraceae), возбудители пятнистости и галлов. Хозяйственное значение протомициевых невелико, некоторые виды могут вредить культурным растениям — тмину, моркови, кориандру.

Фикомице́ты, также сифомице́ты, низшие грибы — гетерогенная внесистематическая группа организмов, ранее принимавшаяся в качестве класса грибов.