Кубанский бассейновый округ — один из 20 бассейновых округов России.
Аби́н — река в Краснодарском крае России, впадает в Варнавинское водохранилище. Длина реки — 81 км. Площадь водосборного бассейна — 484 км².
Адагум — река в Краснодарском крае России, левый приток Кубани. Длина реки — 66 км, площадь водосборного бассейна — 336 км².
Армянка или Гузерипль — горная река в России, протекает по территории Майкопского района Адыгеи. Устье реки находится на 215 км по левому берегу реки Белой. Длина реки — 12,5 км, площадь водосборного бассейна — свыше 37,8 км².
Келерме́с — река в Республике Адыгея. Протекает по территории Майкопского и Гиагинского районов.
Сахрай — река в России, протекает по территории Майкопского района Республики Адыгеи.
Гечепсин (Гошепсин, Гочепсин) — река в России, протекает в Краснодарском крае. Устье реки находится в плавнях Варнавинского Сбросного канала. Длина реки — 23 км, площадь водосборного бассейна — 91,5 км². Принимает в 3,5 км от устья реку Мекерстук.
Кудако — река в России, протекает в Краснодарском крае. Устье реки находится в Варнавинском сбросном канале. Длина реки — 34 км, площадь водосборного бассейна — 121 км². У Кудако есть правый приток — река Русская длиной почти в 10 км.
Мекерстук — река в России, протекает в Крымском районе Краснодарского края. Устье реки находится по правому берегу реки Гечепсин. Длина реки — 16 км, площадь водосборного бассейна — 13,7 км².
Непиль — река в России, протекает по территории Крымского района Краснодарского края. Устье реки находится сейчас в Варнавинском сбросном канале.
Псебепс (адыг. Псыбэпс) — река в России, протекает по территории Крымского района Краснодарского края, раньше был левым притоком Адагума. Длина реки — 37 км, площадь водосборного бассейна — 146 км².
Псиф — река в России, протекает по территории Крымского района Краснодарского края. Устье реки находится сейчас в Варнавинском сбросном канале. Длина реки — 16 км, площадь водосборного бассейна — 45,4 км².
Чекон — река в Краснодарском крае России. Впадает в реку Капиляпсин, которая впадает в систему водоёмов рыбопитомника, расположенную вдоль русла Кубани. Устье сильно канализировано. Длина реки — 12 км.
Чекупс — река в России, протекает в Краснодарском крае. Устье реки находится в плавнях реки Кубани. Длина реки — 12 км, площадь водосборного бассейна — 37,1 км². Название переводится как «грунтовая речка».
Шуха — река в России, протекает по территории Крымского района Краснодарского края. В настоящее время впадает в Варнавинский Сбросной канал. Длина реки — 12 км, площадь водосборного бассейна — 27,1 км².
Чибий — река в России, протекает в Краснодарском крае, Адыгеи. Длина реки — 33 км, площадь её водосборного бассейна — 242 км². Река образуется при слиянии рек Большой Чибий и Малый Чибий. Впадает в Шенджийское водохранилище, из которого вытекает Чибийский канал, устье канала находится на 237 км левого берега реки Кубани. Местами река пересыхает.
Ма́рта — река в России, протекает в Краснодарском крае и Адыгее, впадает в Краснодарское водохранилище у села Джиджихабль. Длина реки составляет 68 км, площадь водосборного бассейна — 726 км².
Губс — река в России, протекает по Краснодарскому краю и Адыгее. Устье реки находится в 22 км от устья реки Ходзь по левому берегу. Длина реки — 49 км, площадь водосборного бассейна — 250 км².
Неволька — река в России, протекает по территории Кошехабльского района Адыгеи. Устье реки находится в 49 км по правому берегу реки Чохрак. Река сильно канализирована, бо́льшую часть русла реки сейчас занимает канал «Ходзь — Неволька». Ранее длина реки была 28 км, а площадь водосборного бассейна — 123 км².
Варнавинское водохранилище — водохранилище в Крымском районе Краснодарского края, в русле реки Адагум, левого притока Кубани. Создано путем обвалования части Абино-Северских лиманов и прилегающих к ним земель. Наполнение закончилось в 1971 году.
— исток, 
— устье
