Андобка — река в Вологодской области России, протекает по территории Череповецкого района и по границе Шекснинского района. Устье реки находится в 30 км от устья Кономы по левому берегу. Длина реки составляет 12 км.
Вожерка — река в России, протекает по Ярославской области. Исток реки находится менее чем в 1 км к западу от деревни Устимово, течёт на север, затем северо-восток через деревни Чудимово, Демидково, Ворошилки, Колотово, Стряпково. Устье реки находится в 72 км от устья Ухр по левому берегу. Длина реки составляет 27 км. Площадь водосборного бассейна — 139 км².
Воля — река в России, протекает по Рыбинскому району Ярославской области. Исток реки находится к югу от деревни Кузнецово, река течёт на север, а после деревни Кузнецово поворачивает на северо-запад, протеккает через Большое Погорелово, вблизи Милюшино и около деревни Костино впадает в водохранилище. Устье реки находится по левому берегу Рыбинского водохранилища, ниже (южнее) устья реки Ухра и выше (севернее) устья ручья Татьянка. Длина реки составляет 12 км.
Глухая Репа — река в Вологодской и Ярославской областях России.
Имая — река в России, протекает по территории Шекснинского района Вологодской области. Устье реки находится в 3 км от устья по правому берегу реки Угла между деревнями Нижний Дор и Мальгино. Длина реки составляет 13 км.
Кода — река в России, протекает по Пошехонскому району Ярославской области. Устье реки находится в 6,9 км от устья Репы по правому берегу. Длина реки — 15 км, площадь водосборного бассейна — 53,7 км².
Конома — река в Череповецком районе Вологодской области России, впадает в Кономский залив Шекснинского руслового участка Рыбинского водохранилища. Длина реки составляет 57 км, площадь водосборного бассейна — 283 км².
Кучесара — река в России, протекает в Череповецком районе Вологодской области. Устье реки находится в 8,1 км по левому берегу реки Ягорба. Длина реки составляет 11 км.
Маткома — река в России, протекает по границе Пошехонского района Ярославской и Череповецкого района Вологодской областей. Берёт своё начало в болотах. Устье реки находится на северо-востоке Рыбинского водохранилища между сёлами Малафеево и Гаютино. Длина реки составляет 48 км, площадь водосборного бассейна — 324 км². Правый приток — река Барка.
Патра — река в России, протекает по Пошехонскому и Первомайскому районам Ярославской области. Устье реки находится в 19 км по левому берегу реки Согожа. Длина реки — 23 км, площадь водосборного бассейна — 131 км².
Песочная — река в России, протекает по Тверской области. Устье реки находится в 28 км по правому берегу реки Болотея. Длина — 26 км. Отметка уровня воды в устье 141,7 м.
Пишковка — река в России, протекает по Вологодской области, к северо-востоку от деревни Пача. Правый приток Шексны. Исток реки находится южнее деревни Демидово. Русло реки почти на всем протяжении спрямлено осушительными каналами. Устье реки находится по правому берегу водохранилища Рыбинское на Шекснинском русловом участке. Длина реки составляет 15 км.
Радуга — река в России, протекает по Сандовскому и Весьегонскому районам Тверской области. Устье реки находится в 51 км от устья Рени по левому берегу. Длина реки составляет 35 км, площадь водосборного бассейна — 147 км².
Роица — река в России, протекает в Шекснинском районах Вологодской области. Устье реки находится в 12 км по правому берегу реки Угла. Длина реки составляет 25 км.
Томша — река в России, протекает по территории Пошехонского района Ярославской области. Устье реки находится в 9,2 км по левому берегу реки Сога. Длина реки составляет 12 км.
Ушло́нка — река в Ярославской области России, правый приток Ухры, протекает по Даниловскому району. Река Ушлонка начинается в мелиоративных каналах в урочище Цветково, в эти канавы течёт река Патра. Ушлонка течёт в основном на юг и юго-запад. По её руслу стоят деревни Станово, Симаново, Юрино, Агафоново, Леоньково, Дитино, Иванники, Григорево. Устье реки находится в 61 км по правому берегу реки Ухра, между деревнями Слобода и Берег. Длина реки составляет 30 км.
Харенец — река в России, протекает по Рыбинскому району Ярославской области. Устье реки находится в Рыбинском водохранилище. Длина реки составляет 11 км.
Хмелёвка — река в России, протекает по Череповецкому району Вологодской области. Устье реки находится в 65 км по правому берегу реки Большой Юг. Длина реки составляет 11 км.
Цыня — река в России, протекает в по территории Первомайского и Пошехонского районов Ярославской области. Устье реки находится в 53 км по левому берегу реки Сога. Длина реки составляет 11 км.
Чимсора — река в России, протекает по территории Ягницкого сельского поселения Череповецкого района Вологодской области, большей частью по территории Дарвинского заповедника. Длина реки составляет 21 км.
— исток, 
— устье
