
Черёмуха — река в европейской части России, протекает по Ярославской области и впадает в Волгу в центре Рыбинска.
Пунтрохоть — река в России, левый приток Волги, протекает по Тутаевскому району Ярославской области. Течёт в лесной местности преимущественно на юг. Протекает на небольшом удалении между деревнями Созаново, Михеево, Холм, Фелисово, Мишаки. Непосредственно на реке расположены деревни Петрунино, Кренево, Каботово. Отметка уровня воды в Каботово 102,5 м. После Каботово в реку впадает правый приток Дерножка. Перед впадением в Волгу круто поворачивает на восток, огибая прибрежную возвышенность и впадает в Волгу рядом с устьем более крупной реки Урдома. Между устьями этих рек деревня Вознесенье с церковью, на карте отмеченная как нежилая. Устье реки находится в 2673 км по левому берегу Волги. Длина реки составляет 13 км.
Сундоба — река в России, впадает в волжское Горьковское водохранилище слева, протекает в Рыбинском районе Ярославской области.

Уткашь — река в России, протекает по Рыбинскому району Ярославской области. Устье реки находится в 2708 км по правому берегу вдхр Горьковское, в городе Рыбинске. Длина реки составляет 22 км, площадь водосборного бассейна 54,5 км².

Эдома — река в России, течёт по территории Ярославской области. Впадает в Волгу по правому берегу в 2677 км от её устья, в районе Горьковского водохранилища. Длина реки составляет 26 км, площадь водосборного бассейна — 128 км².
Воля — река в России, протекает по Рыбинскому району Ярославской области. Исток реки находится к югу от деревни Кузнецово, река течёт на север, а после деревни Кузнецово поворачивает на северо-запад, протеккает через Большое Погорелово, вблизи Милюшино и около деревни Костино впадает в водохранилище. Устье реки находится по левому берегу Рыбинского водохранилища, ниже (южнее) устья реки Ухра и выше (севернее) устья ручья Татьянка. Длина реки составляет 12 км.
Желемья — река в России, протекает по территории Весьегонского района Тверской области. Устье реки находится в 19 км от устья Кесьмы по левому берегу. Длина реки составляет 29 км.
Ко́нгора — река в России, протекает в Пошехонском районе Ярославской области. Длина реки составляет 39 км. Площадь водосборного бассейна — 238 км².
Нотелга — река в России, протекает по Вологодскому району Вологодской области и по границе с Ярославской областью. Исток реки образуется слиянием у нежилой деревни Павлово ручьёв Чёрного и Котел в. Река течёт на юго-восток по лесной ненаселённой местности. В 7,8 км от устья, по левому берегу реки впадает река Янгосорка. Ниже устья Янгосорки граница областей проходит по реке — правый берег Ярославская, левый — Вологодская область. Устье реки находится в 12 км по правому берегу реки Сегжи, у деревни Леушкино, расположенной на левом, вологодском берегу.
Печевка — река в России, протекает по Пошехонскому району Ярославской области. Длина реки составляет 21 км. Площадь водосборного бассейна — 67,1 км².
Сёбла (Себла) — река в Ярославской и Тверской областях. Впадает в Рыбинское водохранилище.
Харенец — река в России, протекает по Рыбинскому району Ярославской области. Устье реки находится в Рыбинском водохранилище. Длина реки составляет 11 км.
Чимсора — река в России, протекает по территории Ягницкого сельского поселения Череповецкого района Вологодской области, большей частью по территории Дарвинского заповедника. Длина реки составляет 21 км.
Инопаш — ручей в России, левый (последний) приток Шексны, протекает в Рыбинском районе Ярославской области. Длина водотока 22 км, площадь водосбора 61,8 км².
Кема — река в России, протекает по Первомайскому району Ярославской области. Длина реки составляет 22 км. Площадь водосборного бассейна — 134 км².
Волготня — несудоходная река в России, протекает в Рыбинском районе Ярославской области, впадает в Рыбинское водохранилище, до его строительства была левым притоком Шексны.
Фоминский — ручей в России, протекает в Судоверфском сельском поселении и по северо-западной окраине города Рыбинск в Ярославской области. Правый приток Волги.
Жидогость — река в Назаровском сельском поселении Рыбинского района Ярославской области. Левый приток Волги, впадает в Горьковское водохранилище. Длина — 8 км.
Павловка (Саха) — река в России, протекает в Арефинском сельском поселении Рыбинского района Ярославской области. На топокарте названа Саха. Устье реки находится в 31 км по левому берегу реки Ухра. Длина реки составляет 12 км. Название Саха совпадает с правым притоком Ухры, протекающей восточнее и впадающей в Ухру в 9 км выше по течению. Истоки одноименных рек близки. На плане Генерального межевания Рыбинского уезда 1792 года имеется деревня Павлова, стоящая в устье реки по левому берегу. Высота истока — 144,5 м над уровнем моря.
Вожа — река в России, протекает по Даниловскому району Ярославской области, правый приток реки Ухра. Устье реки находится на 105 км по правому берегу реки Ухра. Длина реки составляет 11 км.