Шефер — фамилия немецкого или еврейского происхождения. Немецкая фамилия — 11-я в Списке наиболее распространённых немецких фамилий.

Ян Ассман — немецкий египтолог, историк религии и культуры.

Карл Ше́фер — австрийский фигурист, двукратный олимпийский чемпион в одиночном катании, семикратный чемпион мира, восьмикратный победитель первенства Европы, двукратный серебряный призёр чемпионатов мира, бронзовый призёр чемпионата мира (1927), серебряный (1928) и бронзовый (1927) призёр чемпионата Европы.

Ха́ральд цур Ха́узен — немецкий медик и учёный, вирусолог, лауреат Нобелевской премии по физиологии или медицине 2008 года, которую разделил с Люком Монтанье и Франсуазой Барре-Синусси. Цур Хаузен открыл роль папилломавирусов в развитии рака шейки матки. Доктор медицины (1960), почётный профессор. Член Леопольдины (1986), иностранный член Американского философского общества (1998).
Мемориал Карла Шефера — ежегодный открытый турнир по фигурному катанию, проводившийся в столице Австрии Вене с 1974 по 2008 год. Соревнования проходили в мужском и женском одиночном катании, в парах и танцах на льду. Однако соревнования в парах и танцах проводились не ежегодно. Обычно турнир проходил в середине октября. В 2009 году он был заменён на турнир «Icechallenge».

Марсель Шефер — немецкий футболист, защитник. Провёл 8 матчей за сборную Германии.

Конрад Шефер — немецкий врач. Один из обвиняемых на Нюрнбергском процессе над врачами. Оправдан.

Ви́нфрид Ше́фер — немецкий футболист, игравший на позиции полузащитника; тренер.

Эрнст Шефер — немецкий исследователь, охотник, зоолог, орнитолог, тибетолог, штурмбаннфюрер СС, руководящий сотрудник Аненербе.

Карл Альбикер — немецкий скульптор, график и педагог.

Йо́ханн Ше́фер, более известный как Ханс Шефер — немецкий футболист. Чемпион мира 1954 года, капитан сборной ФРГ по футболу с 1957 по 1962 год. Всю свою клубную карьеру провёл в «Кёльне».

Отто Генрих Пфальцский — пфальцграф Пфальц-Нойбурга с 1505 года и курфюрст Пфальца с 1556 года из династии Виттельсбахов. Отто Генрих известен как один из крупнейших собирателей искусства, библиофилов и меценатов своего времени.

Хильда Домин, урождённая Лёвенштайн, по мужу — Пальм — немецкая писательница, один из крупнейших лириков Германии второй половины XX века.
Михаэ́ль фон А́льбрехт — немецкий филолог-классик, профессор Гейдельбергского университета (1964). Известнейший труд М. фон Альбрехта в России — «История римской литературы».

Хельмут Койтнер — немецкий режиссёр и актёр. Один из наиболее влиятельных кинорежиссёров в немецком кинематографе.
Томас Шефер — немецкий музыковед и куратор, руководитель Международных летних курсов новой музыки в Дармштадте.
Клаус Густав Генрих фон Байме — немецкий политолог, профессор-эмерит факультета экономики и социальных наук Гайдельбергского университета.
Густав Шефер — немецкий гребец, чемпион летних Олимпийских игр 1936 года в одиночках, чемпион Европы 1934 года, двукратный чемпион Германии.

Освальд Теодор Август Вильгельм Шефер — немецкий юрист, оберштурмбаннфюрер СС, командир айнзацкоманды 9, входившей в состав айнзацгруппы B, начальник гестапо в Мюнхене.

Паулина Шефер — немецкая гимнастка. Специализируется на бревне, где она выиграла золотую медаль на чемпионате мира 2017 года.