
Марьинка — село в Ступинском районе Московской области в составе Аксиньинского сельского поселения.

Еганово — село в городском округе Ступино Московской области.
Спасское — село в Ступинском районе Московской области в составе Леонтьевского сельского поселения. В Спасском на 2015 год одна улица — Спасская, связано автобусным сообщением с населёнными пунктами района. В Спасском находилась Церковь Преображения Господня XVIII века постройки, сломанная в середине XX века.
Оглоблино — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Леонтьевского сельского поселения, на 2015 год — фактически дачный посёлок: при отсутствии официальных жителей в деревне одна улица — Липовая и садовое товарищество. Впервые Оглобино упоминается в 1406 году, в селе существовала Троицкая церковь 1791 года постройки, разрушенная в советские годы.
Коледино — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Леонтьевского сельского поселения. В деревне на 2015 год 5 улиц и переулок, впервые упоминается в 1577 году, с XVII века до середины XIX века в деревне действовала Богословская церковь, в 1903 году была построена часовня Иоанна Богослова.
Ананьино — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Семёновского сельского поселения. На 2015 год Ананьино, фактически, дачный посёлок: при 19 жителях в деревне 2 улицы и 2 садовых товарищества. В Ананьино существовала Архангельская церковь XVI века постройки, сломанная в начале XX века.
Дубечино — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Семёновского сельского поселения. На 2015 год Дубечино, фактически, дачный посёлок: при 22 жителях в деревне 8 улиц, переулок, тупик и 3 садовых товарищества. Впервые в доступных источниках упоминается в 1518 году, как деревня Дубечна, в XVI—XVIII веках в Дубечино действовала Воскресенская церковь, на месте которой в XIX веке была построена не сохранившаяся деревянная часовня. Деревня связана автобусным сообщением с соседними населёнными пунктами.
Каменищи — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Семёновского сельского поселения. На 2016 год в Каменищах 4 улицы и 1 тупик. Впервые в исторических документах селение упоминается в 1339 году. В деревне, с XVII века, стояла церковь Рождества Христова, вначале деревянная, на месте которой в 1873—1882 годах была возведена каменная, закрытая в советские годы. В настоящее время восстанавливается, памятник архитектуры местного значения. На деревенском кладбище в конце XIX века был сооружён кирпичный часовенный столб.

Куртино — село в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Ступино.

Соколова Пустынь — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Ступино. На 2016 год в Соколовой Пустыни 3 улицы, 2 переулка 2 тупика и 10 садовых товариществ.
Тишково — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Ступино. На 2016 год в Тишково 2 улицы — Никольская и Покровская и 2 садовых товарищества, восточнее деревни расположена железнодорожная платформа Ситенка Павелецкого направления Московской железной дороги. В Тишково в XVI веке существовала деревянная Никольская церковь; в 1888 году была построена кирпичная часовня — обе не сохранились.
Кошелевка — село в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Малино.

Четряково — село в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Малино. На 2016 год Четряково, фактически, дачный посёлок — при 7 жителях в деревне 2 улицы — Церковная и Центральная и 5 садовых товариществ.
Игнатьево — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Малино. На 2016 год в Игнатьево 1 улица — Раздольная и 3 садовых товариществак, деревня связана автобусным сообщением с райцентром и соседними населёнными пунктами. В XVIII веке в Игнатьево была построена небольшая деревянная Архангельская церковь, к которой в 1880-х годах была пристроена новая колокольня; сломана в середине XX века.
Савельево — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Малино. На 2016 год Савельево, фактически, дачный посёлок — при 7 жителях в деревне 6 улиц, деревня связана автобусным сообщением с соседними населёнными пунктами. В 1-й половине XIX века в Савельево была сооружена деревянная Преображенская церковь, на месте которой в 1903 году была построена одноглавая кирпичная трехпрестольная, снесённая в середине XX века.
Сафроново — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Малино. На 2016 год в Сафроново 2 улицы — Восточная и Троицкая и 2 садовых товарищества. В Сафроново существовала однопрестольная каменная Троицкая церковь 1816 года постройки, не сохранившаяся до наших дней.
Колычево — село в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Жилёво. На 2016 год в Колычево 5 улиц, деревня связана автобусным сообщением с райцентром и соседними населёнными пунктами, некогда принадлежала боярам Колычевым. У деревни находится источник целителя Пантелеймона.

Кузьмино — село в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Михнево.

Марьинское — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Михнево. На 2016 год в Марьинском 4 улицы, 4 переулка и 2 садовых товарищества.

Рудины — деревня в Ступинском районе Московской области в составе Городского поселения Михнево.